双齿围沙蚕CYP4基因的克隆及序列分析

周一兵,陈雪,杨大佐,万良,王斌,王丽丽,孙静波

(1.大连海洋大学辽宁省海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室,辽宁大连116023;2.国家海洋环境监测中心,辽宁大连116023;3.宝生物工程(大连)有限公司,辽宁大连116600)

双齿围沙蚕CYP4基因的克隆及序列分析

周一兵1,陈雪1,杨大佐1,万良1,王斌1,王丽丽2,孙静波3

(1.大连海洋大学辽宁省海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室,辽宁大连116023;2.国家海洋环境监测中心,辽宁大连116023;3.宝生物工程(大连)有限公司,辽宁大连116600)

根据已知的绿沙蚕Nereis virens细胞色素氧化酶CYP342A1保守区设计引物,采用RACE技术首次从双齿围沙蚕Perinereis aibuhitensis体壁肌肉中克隆出细胞色素氧化酶CYP4基因全长序列。分析结果表明,该序列全长为1 857 bp,5′端非翻译区为186 bp,3′端非翻译区为225 bp,阅读框为1 446 bp,编码为481个氨基酸。第422～431氨基酸序列符合P450所具有的结构保守共有序列FxxGxxxCxG,第319～322氨基酸序列为K螺旋特征基序ExxR区,第282～294氨基酸序列含有CYP4家族特征序列EVDTFMFEGHDTT。经Blast与GenBank中已知物种的氨基酸序列进行同源性比对,CYP4与多毛类绿沙蚕Nereis virens CYP4BB1、CYP342A1(AY453408)氨基酸同源性为73%、36%,与多毛类小头虫Capitella capitata CYP4AT1 (AY574044)同源性为39%。据此推断,双齿围沙蚕CYP4基因属于CYP4B亚家族。

双齿围沙蚕;CYP4;RACE;生物信息学分析

细胞色素P450酶系(CYP酶)是存在于所有生物体中的超基因家族,其中CYP4是细胞色素P450酶系中的一个重要家族。研究表明,CYP4与多种生物代谢、解毒和抗药性机制相关[1-4]。细胞色素氧化酶P450家族是多毛类体内生物转化的第一阶段代谢酶,在外源性化合物代谢中起着极其重要的作用,这与脊椎动物体内的生物转化相似[5]。……