转录组测序及其在牧草基因资源发掘中的应用前景

井赵斌，魏 琳，俞 靓，程积民

(1.西北农林科技大学动物科技学院，陕西 杨凌712100；2.西北农林科技大学资源与环境学院，陕西 杨凌 712100；3.中国科学院水利部水土保持研究所，陕西 杨凌 712100)

目前，在新一代高通量测序技术的推动下，部分动植物全基因组测序工作已经完成或正在进行中，这些基于高通量测序的相关研究逐渐深入到生物学研究的每一个角落，并成为引领生物学研究的基本手段之一。国外许多研究机构和公司正凭借其基因组测序技术、测序设备和测序成本的优势，以期利用基因资源的唯一性，抢先获得基因专利权，从而实现其“一个基因一个产业”的全球垄断局面。但新一代高通量测序技术在我国的研究和应用还处于起步阶段。

我国的牧草种质资源极为丰富，目前的研究主要集中在以全球变化与农业多样性、农业系统固碳减排、草地农业决策系统及林草生态等宏观方面[1]；同时以分子生物学为基础的微观方面也有大量研究成果，主要包括DNA水平上的遗传多样性和分子标记辅助选择育种等方面[2]。而利用新一代高通量测序技术进行牧草种质资源创新与开发的研究鲜见报道。

本研究对新一代高通量测序应用领域最为广泛的转录组测序的基本原理、实验流程、数据分析及其应用进行综述，并结合中国科学院水利部水土保持研究所林草生态研究室进行的抗旱牧草转录组测序研究思路进行浅析，旨在对转录组测序在牧草基因资源发掘及牧草作物种质创新与品种设计育种中产生的可能影响进行展望，为我国牧草资源的开发提供新的研究思路。……