东亚飞蝗血蓝蛋白亚基1基因的原核表达与蛋白结构预测

2013-10-09 11:52张新新游婷刘海霞印红
关键词:飞蝗东亚结构域

张新新,游婷,刘海霞,印红

(河北大学生命科学学院,河北保定 071002)

血蓝蛋白是节肢动物和软体动物血淋巴中的含铜呼吸蛋白,脱氧状态为无色,结合氧状态为蓝色[1].节肢动物血蓝蛋白由6个相同或相似的分子质量在75ku左右的单体组成[2].一个典型的节肢动物血蓝蛋白亚基分为3个结构域,第1个结构域包括N端的150~180个氨基酸,由6~7个α螺旋组成,并通过超二级结构形成稳定的螺旋束;第2个结构域为活性位点,由4个α螺旋束结合2个铜离子——CuA和CuB,每个α螺旋有3个His残基与Cu+结合,这2个Cu+为血蓝蛋白结合O2所必需;第3个结构域是C端,主要由β折叠结构组成,进一步折叠反平行的7股β桶超二级结构[3-4].每个亚基的3个结构域在六聚体中有序排列.节肢动物血蓝蛋白属于一类蛋白质家族,其包括酚氧化酶(phenoloxidases,PO)、甲壳类假血蓝蛋白(crustacean pseudo-hemocyanins,又名cryptocyanin,PHc或Cc)、昆虫存储蛋白(insect storage hexamerins,Hx)、双翅类六聚蛋白受体(dipteran hexamerin receptors,HxR)[5].血蓝蛋白作为三类呼吸功能蛋白之一,不仅承担着氧气传输的功能,而且它还具备能量储存和免疫防御功能[6-7],血蓝蛋白在实验中显示出酚氧化酶活性,甚至可以转化为酚氧化酶[8-10].此外,血蓝蛋白可以结合蜕皮激素而参与其在血淋巴中的运输[6,11].研究表明,血蓝蛋白广泛存在于直翅目昆虫中,但目前相关研究非常少,迄今只有Sanchez等[12]在美洲沙漠蝗Schistocercaamericana的胚胎中调取了Hc1的部分序列,Yin等[13]获取了东亚飞蝗Locustamigratoria manilensisHc1的完整序列.东亚飞蝗Locustamigratoriamanilensis(Mey.)属于直翅目Orthoptera,蝗总科Aeridoidea,斑翅蝗科Oedipodidae,飞蝗属LocustaLinnaeus,是一种重要的农业害虫,是诱发蝗灾的一个重要的蝗虫种类[14].本实验以东亚飞蝗Locustamigratoriamanilensis为研究对象,在获得其Hc1的cDNA完整序列和进行初步分析的基础上[13],进而构建Hc1原核表达载体,重组质粒转化到大肠杆菌BL21(DE3)表达系统中,SDS-PAGE电泳表明:经过IPTG诱导,目的基因可以高效表达[16].同时预测了LmiHc1蛋白的高级结构,以期进一步探讨直翅目昆虫Hc1的功能和作用机理,进而为害虫的生物防治以及昆虫资源的开发利用奠定理论基础.

1 材料与方法

1.1 材料

E.coliTrans1-T1,E.coliBL21(DE3)感受态细胞购自北京全式金生物技术有限公司.原核表达载体pET-DsbA由河北大学柳峰松老师惠赠.东亚飞蝗由本实验室饲养.LATaq聚合酶、2 000u核酸分子质量标准、T4DNA连接酶(快速连接试剂盒)、BamHⅠ,HindⅢ限制性内切酶、DNA琼脂糖凝胶回收试剂盒为Takara公司产品,异丙基硫代P-D-半乳糖苷(IPTG)为AMRESCO产品,质粒小量制备试剂盒、蛋白质Marker系TransGen产品,其他试剂均为国产分析纯.

1.2 方法

1.2.1LmiHc1基因的PCR扩增

取东亚飞蝗成虫1只,迅速解剖去内脏后用液氮冷冻组织,用TRIZOL法提取总RNA.RNA经过琼脂糖凝胶电泳,检测其完整性以及是否有基因组DNA污染;经分光光度计测定其浓度.使用TransScriptTMFirst-Strand cDNA Synthesis SuperMix(TransGen)对RNA进行反转录反应获取cDNA.

根据已提交的LmiHc1基因核苷酸序列(GenBank:HQ213937),用Primer 5.0软件设计扩增LmiHc1部分基因的一对特异性引物F和R,F:5'-CGGCCTACAAGGCCAAGATGAG-3'(下划线为BamHⅠ酶切位点)R:5'-CCTTACACCTGCACCTCCTCGA-3'(下划线为HindⅢ酶切位点).引物由上海生物工程技术服务有限公司合成.PCR扩增预计总长度为750bp.以东亚飞蝗cDNA为模板,F,R为引物扩增LmiHc1部分基因.PCR程序:94℃预变性3min;PCR扩增:94℃变性30s,65℃退火30s,72℃延伸1min,共30个循环;最后72℃终末延伸10min.10g/L琼脂糖凝胶电泳检测所扩增片段的正确性,胶回收试剂盒回收目的片段.

1.2.2 重组质粒的构建

用试剂盒TaKaRa MiniBEST Plasmid Purification Kit Ver.2.0小量提取质粒pET-DsbA.质粒pETDsbA和目的基因经BamHⅠ和HindⅢ双酶切,回收酶切片段,T4连接酶试剂盒作用下25℃连接2h,转化宿主菌,双酶切鉴定筛选出阳性克隆.挑取阳性克隆接种到LA(含100μg/mL氨苄青霉素)液体培养基中,大量增菌后,送往深圳华大基因科技有限公司测序.

1.2.3 pET-DsbA/LmiHc1融合蛋白的诱导表达

将测序正确的阳性重组子质粒分别转化表达宿主菌E.coliBL21(DE3)感受态细胞.筛选转化入重组质粒的表达宿主菌,将其接种于LB/Amp+培养基中,37℃过夜震荡培养,然后取1mL过夜培养物接种于新培养基中,37℃220r/min继续培养至OD600≈0.6时,取1mL菌液于Eppendorf管中,离心弃上清液,收集菌体作为空诱导对照.在剩下的菌液中加入IPTG至终浓度为1mmol/L,诱导3h,然后取1mL,离心弃上清液收集菌体沉淀,同时取空载pET-DsbA菌作为阴性对照.向沉淀中加入100μL 2×SDS上样缓冲液,混匀后沸水浴10min,各取5μL进行质量浓度为100g/L的SDS-PAGE电泳以检测目的蛋白的表达情况.

2 结果与分析

2.1 LmiHc1目的基因PCR的扩增

对东亚飞蝗cDNA片段进行RT-PCR扩增,PCR产物于10g/L琼脂糖凝胶电泳,约750bp处可见明亮的特异带,与预期条带大小相符,结果见图1.

2.2 LmiHc1基因及质粒双酶切纯化回收

pET-DsbA质粒与LmiHc1PCR扩增产物分别用BamHⅠ、HindⅢ双酶切,切胶回收后,经过10g/L琼脂糖凝胶电泳检测,条带大小正确,且呈现单一条带,说明双酶切完全.

2.3 重组质粒鉴定

随机挑取6个重组转化的单菌落进行质粒提取,经过BamHⅠ、HindⅢ双酶切后电泳检测,重组质粒鉴定后都有750bp左右的目的片段,证明pET-DsbA/LmiHc1原核表达载体构建成功,选取1个质粒送测序公司进行测序.

图1 LmiHc1PCR产物Fig.1 PCR product of LmiHc1

2.4 重组融合蛋白LmiHc1的诱导表达

pET-DsbA/LmiHc1转化表达宿主菌BL21(DE3),经过IPTG诱导后,收集菌体沉淀经质量浓度为100g/L的SDS-PAGE电泳检测,结果可见相对分子质量25ku处有1条明显的蛋白条带,与预计的融合蛋白分子质量大小基本相符,同时作为对照组的pET-DsbA空载体也表达了分子质量约25ku的DsbA蛋白,电泳结果如图2所示.

3 Lmi Hc1蛋白的结构分析

通过前期工作获得LmiHc1的cDNA完整序列(GenBank:HQ213937)的分析[15],LmiHc1基因全长为2271bp,包含1个2016bp的完整开放阅读框ORF和1个255bp 3'-UTR,PolyA尾上游15个核苷酸处存在典型的加尾信号AATAAA.

图2 大肠杆菌BL21(DE3)表达LmiHc1重组蛋白的SDS-PAGE分析Fig.2 SDS-PAGE analysis of LmiHc1expression of recombinant protein in E.coli BL21(DE3)

3.1 LmiHc1蛋白质一级结构分析

蛋白质一级结构(primary structure)是指多肽链的氨基酸残基的排列顺序,它是蛋白质最基本的结构.每一种蛋白质分子都有其特有的氨基酸组成和排列顺序,由此决定它的特定空间结构.

利用Signal P 3.0软件分析表明,LmiHc1基因编码的蛋白质N端有18个氨基酸的信号肽,成熟蛋白质含有654个氨基酸,理论分子质量为77.9ku,理论PI为6.06,负电荷残基(Asp+Glu)94个(14.0%),正电荷残基(Arg+Lys)82个(12.2%),疏水性氨基酸(A,I,L,F,W,V)有232个,约占34.5%;极性氨基酸(N,C,Q,S,T,Y)150个,占22.3%;在体外哺乳动物网状细胞中的估计半衰期为30h,在体外有机体内的半衰期大于20h,在大肠杆菌内的半衰期大于10h,蛋白的不稳定指数为44.82,属于不稳定蛋白(不稳定系数大于40的为不稳定蛋白质);疏水性指数为82.93.

3.2 LmiHc1蛋白质二级结构分析

蛋白质二级结构(secondary structure)是指氨基酸残基形成的α螺旋(α-helix)、β折叠(β-sheet)、无规则卷曲(coil)以及基序(motif)等组件.

采用SABLE(http://sable.cchmc.org/)在线工具预测东亚飞蝗LmiHc1蛋白二级结构(图3).结果显示,LmiHc1蛋白质结构为混合型,由α螺旋、β折叠与无规则卷曲组成.

3.3 LmiHc1蛋白质三级结构分析

基于查询序列与已知蛋白序列显著的相似性(相似度>30%)预测其蛋白质三维结构的方法称为同源建模.Swiss-Model是通过完整的同源建模预测蛋白质三维结构的在线工具.其基本操作步骤如下:首先同源鉴定,Swiss-Model程序使用BLAST在PDB数据库中筛选出符合P值小于10-5(BLAST)及靶序列一致性不小于30%(SLM)的模板序列用于建模;然后,对所得的多模板进行结构比对,剔除不匹配模板;再根据模板序列与靶序列的局部一致性原理,由ProModⅡ确定其核心骨架以及环和侧链;最后用Gromos程序进一步优化能量.

采用Swiss-Model上提供的第1步模式(First Approach Mode)对LmiHc1蛋白序列进行建模(图4).提交序列后返回结果显示:建模为24~669个氨基酸,参考模板为1hcyC,目标蛋白与参考蛋白的序列比对的一致性为43.19%,模型评估E值为0.00e-1.

图3 预测LmiHc1蛋白二级结构Fig.3 Secondary structure of LmiHc1

图4 预测东亚飞蝗LmiHc1蛋白三级结构Fig.4 Tertiary structure of LmiHc1

利用NCBI的CD search分析血蓝蛋白的结构域(图5),其中Query seq为LmiHc1氨基酸序列,Specific hits指特异性位点,Superfamilies指节肢动物血蓝蛋白超家族.结果显示LmiHc1含有节肢动物血蓝蛋白家族蛋白所具有的3个结构域:Hemocyanin_N,Hemocyanin_M,Hemocyanin_C.其中Hemocyanin_M为结合铜离子的结构域.

图5 LmiHc1蛋白结构域分析Fig.5 LmiHc1protein domain analysis

4 讨论

血蓝蛋白作为3大类呼吸功能蛋白之一,不仅承担着氧气传输的功能,而且还具备能量储存和免疫防御等功能,血蓝蛋白不仅在实验中显示出酚氧化酶活性,甚至可以转化为酚氧化酶;此外,血蓝蛋白可以介导蜕皮激素在血淋巴中的转运并参与调节蜕皮.近年来,血蓝蛋白的功能、作用机理、进化地位已经引起各国学者的浓厚兴趣,血蓝蛋白的新功能及其作用机理仍有待于进一步挖掘和深究.东亚飞蝗Locustamigratoria manilensis是中国飞蝗的3个亚种之一,中国史籍中的蝗灾,主要是东亚飞蝗,先后发生过800多次,分布于北纬42℃以南的东部季风区的平原地区,北起河北、陕西、山西,南达海南、广东、广西、云南,东至沿海各省及台湾,西至四川、甘肃南部[15].为了研究东亚飞蝗血蓝蛋白的结构和功能,本文对东亚飞蝗血蓝蛋白亚基1插入合适的载体后导入大肠杆菌进行重组蛋白表达,并对蛋白质结构进行了预测,结果LmiHc1可以在大肠杆菌中正常表达,为进一步研究其蛋白结构和功能打下了基础,进而为害虫的生物防治以及昆虫资源的开发利用奠定理论基础.

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