李江曼,韩雪娜,袁 果,2,陈莉莎,2,侯志超,户彦龙,2,李 丹,3,黄 佳,王立东,2*
(1.郑州大学第一附属医院 河南省食管癌重点开放实验室,郑州大学 基础医学院,河南 郑州 450052;2.新乡医学院,河南 新乡 453003;3.河南省荣康医院,河南 新乡 453003)
提取优质的基因组DNA是目前肿瘤分子生物学研究能否取得重要结果的关键。外周血标本采集方便,不受地点、时间等客观因素的影响,是肿瘤分子生物学研究中使用最广泛的标本。血样离体后可立即进行预处理,甚至立即提取DNA、RNA等。但是在科研实践中,病例标本来源多零散,采集的血液样品不能立即处理,需要暂时存放,甚至在-70 ℃以下[1]的深低温冰箱存放数年,待收集样品达一定数量后才能开始进行研究。提取DNA质量的好坏对研究有很大影响[2]。冰冻外周血标本提取DNA的质量是否受存放时间的影响尚不十分清楚。为此,我们通过分析比较-80 ℃冻存1 a、2 a、3 a和4 a的外周血标本提取DNA质量,为研究者提供冻存时间对外周血提取DNA质量影响的相关数据。
40例血液标本(-80℃储存1 a、2 a、3 a和4 a的标本各10例)均来自河南省食管癌重点开放实验室生物样品资料库。血样采集:在采集对象知情同意的情况下,抽取5 mL空腹外周静脉血,EDTA-K2抗凝[3],-80℃冰箱保存备用。
DNA提取试剂盒FlexiGene DNA Kit(250)[4]购于Qiagen公司。全血标本从-80℃冰箱里取出后,进行梯度解冻(-40 ℃ 24 h,-20 ℃ 24 h,4 ℃ 24 h)。取450 μL全血样品,按试剂盒提供方法进行DNA抽提。提取DNA置4 ℃冰箱待用。
DNA电泳:采用质量分数为1%琼脂糖进行电泳,BTS-20.M全自动数字显影凝胶成像系统和LUV-260D紫外线投射仪进行图像采集。……