基于16S rRNA和rpoB基因的分子系统发育分析在铜绿假单胞菌鉴定中的应用

何艳霞，向诗非，李浇，何金蕾，张俊荣，袁冬梅，秦翰霄，陈达丽*，陈建平*

(1.四川大学华西基础医学与法医学院寄生虫学教研室，四川成都610041; 2.湖北民族学院医学院寄生虫学教研室，湖北恩施445000; 3.湖北民族学院附属民大医院风湿免疫科，湖北恩施445000)

基于16S rRNA和rpoB基因的分子系统发育分析在铜绿假单胞菌鉴定中的应用

何艳霞1，2，向诗非3，李浇1，何金蕾1，张俊荣1，袁冬梅1，秦翰霄1，陈达丽1*，陈建平1*

(1.四川大学华西基础医学与法医学院寄生虫学教研室，四川成都610041; 2.湖北民族学院医学院寄生虫学教研室，湖北恩施445000; 3.湖北民族学院附属民大医院风湿免疫科，湖北恩施445000)

为对比16S rRNA和rpoB基因分子系统发育分析与传统表型分类法对铜绿假单胞菌的鉴定，评估16S rRNA和rpoB基因序列分析在铜绿假单胞菌鉴定中的应用，用表型分类方法对临床自动微生物鉴定系统鉴定为铜绿假单胞菌的23株分离株进行再鉴定，PCR扩增23株分离株16S rRNA和rpoB基因片段，并测序进行系统发育分析。结果表明，表型再鉴定结果与自动微生物鉴定系统鉴定结果一致。基于两个基因的系统发育分析均显示分离株p22与不动杆菌属序列聚为一枝，其余22株分离株与铜绿假单胞菌序列聚为一枝。因此p22应鉴定为不动杆菌，16S rRNA和rpoB基因序列分析均能准确鉴定铜绿假单胞菌并能较好建立假单胞菌属内种间关系。

铜绿假单胞菌;16S rRNA;rpoB

铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)广泛分布于自然界，是一种条件致病菌，可感染人体的任何部位和组织，出现局部化脓性炎症。铜绿假单胞菌也广泛分布于医院环境，在医院感染病例中，由铜绿假单胞菌引起的医院感染占据首位［1］。……