A37-42形成二聚体的分子模拟研究

2016-09-02 08:08:37刘巧菊
复旦学报(自然科学版) 2016年1期
关键词:结构

刘巧菊,吴 荻

(复旦大学 生命科学学院 生理学和生物物理学系,上海 200438)



刘巧菊,吴荻

(复旦大学 生命科学学院 生理学和生物物理学系,上海 200438)

阿尔茨海默症是一种神经退行性疾病,多发病于老年人群.该疾病不但严重影响患者的健康及正常生活,还给患者家属带来极大痛苦.因此治疗该疾病成为科学界急欲攻克的难关.而治疗的基础是解析病理,大量研究表明该病患者脑内有大量纤维状A蛋白质聚集物.因此研究A蛋白质如何聚集是解析病理的关键.同时预防和阻止A蛋白质聚集也成为治疗阿尔茨海默症的一种可选方案.本文即选取A蛋白质片段,以分子动力学模拟方法,详细分析其形成稳定二聚体的完整过程.研究发现该蛋白质片段上残基侧链之间的疏水作用促使两个A单体相互靠近,其间会形成多种非稳态中间体,其结构经过不断调整最终才形成稳定的二聚体结构.该结构调整过程对形成稳定的二聚体结构非常重要.在此过程中两条肽链主链形成氢键的个数逐渐增加,同时伴随形成了新的残基侧链之间的相互作用.研究发现在二聚体形成的全过程中Ile41和Ala42均起到不可忽视的作用.Ile41由于其侧链具有疏水性且体积相对较大,可通过其疏水作用力促使两个单体相互靠近.而Ala42在后期结构调整中发挥了一定作用,稳定了二聚体的结构.该研究有助于更好地理解A蛋白质聚集特别是其形成二聚体的过程,同时也为防治A蛋白质聚集提供了一些理论依据.

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