副溶血性弧菌16S rRNA基因序列变异规律分析

冯　博，　蓝　英，　孙晓红，　张炜佳，　潘迎捷，　赵　勇*

（1.上海海洋大学 食品学院，上海 201306；2.上海水产品加工贮藏工程技术研究中心，上海 201306；3.农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室（上海），上海 201306）

副溶血性弧菌16S rRNA基因序列变异规律分析

冯博1，2，3，蓝英1，2，3，孙晓红1，2，3，张炜佳1，2，3，潘迎捷1，2，3，赵勇*1，2，3

（1.上海海洋大学 食品学院，上海 201306；2.上海水产品加工贮藏工程技术研究中心，上海 201306；3.农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室（上海），上海 201306）

通过对副溶血性弧菌16S rRNA基因序列进行深度分析，研究其序列变异特点，为开发新的分型溯源靶点奠定基础。对111株分离自生鲜水产品的副溶血性弧菌16S rRNA基因测序，与GenBank中已有的副溶血性弧菌16S rRNA基因标准序列比对分析，对变异度比较大的序列建立了系统发育树，深入分析了基因的变异规律，并使用ERIC-PCR方法加以验证。不同副溶血性弧菌菌株16S rRNA基因变异主要集中在可变区V1和V2区，50～270 bp的区域内有38个碱基的相似度小于30%，103个碱基的相似度在30%～100%。另外，在V3区和V8区也各有1个碱基有比较明显的差异。副溶血性弧菌16S rRNA基因序列具有一定的变异性，该结果为副溶血性弧菌菌株分型溯源分析提供新的靶点奠定研究基础，同时为其微进化研究奠定理论基础。

副溶血性弧菌；16S rRNA基因序列；ERIC-PCR聚类分析；变异规律分析

副溶血性弧菌（Vibiro parahaemolyticus）是一种革兰氏阴性嗜盐菌，广泛分布于各种淡水、海水、河口等水生环境，是水产品中最主要的食源性致病菌之一，极易引起肠道疾病［1-2］。自从1950年在日本首次发现V.parahaemolyticus以来，世界各地尤其是沿海地区都出现过不同程度的疾病爆发，造成了极大的安全隐患。……