RD105缺失基因检测法在结核分枝杆菌分型中的应用※

2016-12-13 07:33:51杜文琪汪海静苏效东文国颖王兆芬
中国高原医学与生物学杂志 2016年3期
关键词:方法

李 斌,刘 寿,杜文琪,汪海静,苏效东,文国颖,梁 军,王兆芬

(青海大学医学院公共卫生系,810001 西宁)



RD105缺失基因检测法在结核分枝杆菌分型中的应用※

李 斌,刘 寿,杜文琪,汪海静,苏效东,文国颖,梁 军,王兆芬*

(青海大学医学院公共卫生系,810001 西宁)

目的 探讨RD105缺失基因检测法在结核分枝杆菌分型中的应用。方法 133株结核分枝杆菌分别采用Spoligotyping分型法和RD105基因缺失法鉴别北京基因型。结果 133株结核分枝中114株为北京基因型,占85.7%,19株为非北京基因型,占14.3%,经RD105缺失基因检测133株结核分枝杆菌临床分离株中,115株为北京基因型,占86.4%,18株为非北京基因型,占13.6%,Spoligotyping基因分型法与RD105缺失基因检测法比较差异无统计学意义(χ2=0.333,P=0.563),RD105缺失基因检测法的灵敏度为99.1%,特异度为89.5%,阳性预测值为98.3%,阴性预测值为94.4%。ROC曲线下面积为0.943。结论 RD105基因缺失法检测可以替代Spoligotyping基因分型法。

结核分枝杆菌 RD105 Spoligotyping ROC曲线下面积

随着分子生物学技术的不断发展,结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)基因型分型技术在该病的流行病学研究中起到了重要的作用,通过对MTB的分型可以判断出该区域流型菌株的类型、病例与病例之间的关系等。MTB中有一组具有相似遗传特征的北京型基因(Beijing genotype)。之前有研究表明青海省流行菌株为北京基因型[1]。北京基因型菌株是一类源于共同祖先的后代菌株,自1995年有van Soolingen等首次报道以来,全球已发现该菌株的流行,在亚洲地区该菌株为主要流行菌株。近年来随着研究深入,研究者发现在北京基因型中RD105存在缺失区域,提出了RD105可以作为北京基因型菌株的分子标志物[2]。……

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