彭勇陈尚武马会勤
(1. 中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京100083;2. 中国农业大学园艺学院,北京100193)
黑果枸杞果实成熟发育过程表达谱差异分析
彭勇1陈尚武1马会勤2
(1. 中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京100083;2. 中国农业大学园艺学院,北京100193)
对黑果枸杞(Lycium ruthenicum Murr.)3个不同发育时期的果实进行转录组测序,分析对比黑果枸杞果实不同发育时期相关基因表达谱的变化。提取果实RNA进行Illumina高通量测序,利用GO、KEGG等公共数据库进行功能注释、分类,利用数字基因表达谱技术对比分析。结果显示,KEGG pathway 富集分析表明亮氨酸生物合成途径在变色期对比青果期有7个差异表达基因,黑熟期对比变色期有35个差异表达基因,且全部为上调表达。在糖酵解途径中3个不可逆的反应步骤限速酶基因在黑熟期均为上调表达。对黑果枸杞亮氨酸合成和糖酵解涉及到的基因进行了功能和代谢通路的分析,为黑果枸杞种质资源探索提供理论基础。
黑果枸杞;果实发育;基因表达谱;差异表达
黑果枸杞(Lycium ruthenicum Murr.)是在我国西北干旱盐碱地生境广泛分布的多年生灌木,是一种集盐碱地绿化价值、防护林价值、药食用价值等于一体的野生优良水土保持植物。黑果枸杞果实中富含枸杞多糖[1,2]、色素[3,4]、类黄酮[5]、甜菜碱[6]、微量元素、脂肪酸、挥发油、维生素等多种成分,其果实提取物在抗氧化[7]、调节免疫力[8]、抗疲劳[9]、降血脂[10]、治疗心血管系统疾病、抗动脉硬化[11]、抗衰老等方面均有明确作用。
除对黑果枸杞……