生物样本库中血液RNA提取方法的介绍

2017-02-16 08:21:31章佳英嵇承栋万悦竹付强强朱琳懿
中国医药生物技术 2017年1期
关键词:方法质量研究

章佳英,嵇承栋,万悦竹,付强强,朱琳懿

生物样本库中血液RNA提取方法的介绍

章佳英,嵇承栋,万悦竹,付强强,朱琳懿

RNA 在人类的多种生理和病理过程中发挥着举足轻重的作用[1-2]。随着第二代测序技术的发展[3],针对人类不同疾病的 RNA 样本测序研究广泛开展,并得到了大量有价值的发现。高质量的 RNA 可以满足 RT-PCR、qRT-PCR、Northern blot、基因表达谱、转录组测序、核酸酶保护实验和阵列分析等生物学下游实验的研究需求[4-5]。

在脊椎动物中,外周血一直被认为是侵害性较小、较有价值的 RNA 来源[6-7]。在许多生物样本库中,由于血液样本的常规收集、处理及保存方法简便、成本低且富含可利用成分(如血清、血浆、白细胞和红细胞等)和生物分子(DNA、RNA、蛋白质和代谢产物),因此是进行多个项目分析的理想实验材料。然而,RNA 极易降解,许多因素如内源性和外源性的 RNA 酶、预处理、保存和提取过程,可能会不同程度地影响 RNA 实验结果。因此,必须注意样本收集、处理和储存过程中的各个环节,从根本上确保获得高质量的RNA[8]。

以前的研究比较了不同采样技术或提取方法对 RNA的影响[9-10],但是尚无关于血液样本 RNA 抽提的系统报道。因此,本文评估各种不同采样技术结合提取方法,比较不同方法对血液 RNA 产量和质量的影响。本研究目的是找到最合适的血液 RNA 提取方案,以便在生物样本库中作批量应用。

1 RNA 提取方法

常见的 RNA 提取方法有苯酚法、阴离子去污剂法、热硼酸法或改良热硼酸法、LiCl-尿素法、改良的 Gomez 法、异硫氰酸胍法、TRIzol 试剂快速提取法、CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)法。……

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