玉米大斑病菌Homeobox转录因子家族全基因组鉴定及其表达规律分析

赵洁，赵立卿，巩校东，冯胜泽，刘星晨，郑亚男，李志勇，孙海月，王冬雪，韩建民，谷守芹，董金皋

（1河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室，河北保定 071000；2河北省农林科学院谷子研究所，石家庄 050000）

玉米大斑病菌Homeobox转录因子家族全基因组鉴定及其表达规律分析

赵洁1，赵立卿1，巩校东1，冯胜泽1，刘星晨1，郑亚男1，李志勇2，孙海月1，王冬雪1，韩建民1，谷守芹1，董金皋1

（1河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室，河北保定 071000；2河北省农林科学院谷子研究所，石家庄 050000）

【目的】从全基因组水平上鉴定玉米大斑病菌（Setosphaeria turcica）Homeobox转录因子家族及其分布，阐明该家族的序列及进化特征，分析该家族基因在病菌不同生长发育时期的表达规律。【方法】利用生物信息学手段搜索玉米大斑病菌全基因组数据库，鉴定Homeobox转录因子家族；采用MEGA 5.0软件进行系统进化树分析；利用在线工具GSDS（gene structure display server）（http://gsds1.cbi.pku.edu.cn/index.php）绘制基因结构图；利用Clustal X 1.83软件分析Homeobox保守结构域(HOX保守结构域）的氨基酸序列特征；利用SOPMA（https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.plpage=npsa_sopma.html）对Homeobox蛋白的二级结构进行在线预测；利用实时荧光定量 PCR（qRT-PCR）技术分析Homeobox转录因子家族在病菌不同发育时期的表达模式。【结果】在玉米大斑病菌中鉴定了8个Homeobox转录因子家族成员（StHTF1-8），根据基因结构及系统进化特征将其分为4类；亚细胞定位预测分析表明，这8个蛋白全部定位在细胞核中；该家族成员均含有HOX保守结构域，其二级结构具有特征性的“螺旋-转角-螺旋”（helix-turn-helix）结构；利用qRT-PCR技术对该家族成员在菌丝、分生孢子形成、芽管形成、附着胞及侵入丝……