李海龙,宋耀辉,陈兆峰,王晶,2,田一虹,2,王圆圆,2,陈彻,牛媛瑕
(1.甘肃中医药大学临床医学院临检基础教研室,兰州 730000;2.甘肃省中医方药挖掘与创新转化重点实验室,甘肃省中药新产品创制工程实验室,兰州 730000;3.兰州大学第一医院消化科,兰州 730000;4.甘肃中医药大学附属医院检验科,兰州 730000)
·肿瘤与微环境检测·
miR-20a-5p/miR-20b-5p在胃癌细胞和组织中的表达及调控靶基因信号通路富集分析*
李海龙1a,2,宋耀辉1,陈兆峰3,王晶1,2,田一虹1,2,王圆圆1,2,陈彻1,牛媛瑕4
(1.甘肃中医药大学临床医学院临检基础教研室,兰州 730000;2.甘肃省中医方药挖掘与创新转化重点实验室,甘肃省中药新产品创制工程实验室,兰州 730000;3.兰州大学第一医院消化科,兰州 730000;4.甘肃中医药大学附属医院检验科,兰州 730000)
目的观察miR-20a-5p/miR-20b-5p在胃癌细胞和胃癌组织中的表达,并用生物信息学方法分析其靶基因和富集的信号通路,探讨其生物学行为和功能。方法采用实时荧光定量PCR法检测miR-20a-5p/miR-20b-5p在不同分化程度(高、中、低)的胃癌细胞和正常胃黏膜细胞以及其在胃癌组织和癌旁组织中的表达水平,并分析其临床意义,采用mirWALK网站数据库的预测软件预测其靶基因,选择该网站10个软件中具备3个以上软件支持的靶基因,用DAVID 6.7在线富集其靶基因参与的信号通路。结果miR-20a-5p/miR-20b-5p在不同分化程度(高、中、低)的胃癌细胞中表达上调(P均<0.05),胃癌组织相对于癌旁组织亦明显上调表达(P<0.05),miR-20b-5p表达上调与胃癌淋巴结侵袭转移以及浸润深度关系密切(P均<0.05);生物信息学分析提示,miR-20a-5p/miR-20b-5p的靶基因富集存在于肿瘤相关的多个信号通路中。结论miR-20a-5p/miR-20b-5p在胃癌细胞系及组织中呈高表达,并于与淋巴结侵袭转移以及浸润深度有关,可作为胃癌潜在的生物学标志物。
miR-20a-5p;miR-20b-5p;胃癌
研究证实,microRNAs(miRNAs)与胃癌的发生发展、侵袭转移、对化疗药物耐药、临床病理参数等关系十分密切[1-2]。miRNA发挥着类似于抑癌基因和癌基因的功能, 在肿瘤发生过程中起至关重要的作用,已经成为特异性的胃癌分子标志物之一。……