人肝细胞癌细胞DNA甲基化谱的检测及分析

孙宁，张佳林，张城硕，周翔宇，陈保民

（中国医科大学附属第一医院肝胆外科暨器官移植科，沈阳 110001）

人肝细胞癌细胞DNA甲基化谱的检测及分析

孙宁，张佳林，张城硕，周翔宇，陈保民

（中国医科大学附属第一医院肝胆外科暨器官移植科，沈阳 110001）

目的检测人肝细胞癌细胞的DNA甲基化谱，明确肝细胞癌细胞中差异甲基化位点和基因的表达分布情况，进一步探讨DNA异常甲基化与肝细胞癌发生发展的关系。方法使用DNA甲基化芯片（Infinium Human Methylation 450K BeadChip）检测人肝细胞癌细胞Huh7和人永生化肝细胞L02的甲基化谱，并对检测结果进行生物学分析。结果共检测到差异性甲基化位点102 254个，差异性甲基化基因26 511个，甲基化相关信号通路43个，其中57.3%的高甲基化CpG位点和39.4%的低甲基化CpG位点的甲基化差异程度≥50%，筛选后确定了3 222个显著高甲基化基因和2 204个显著低甲基化基因。结论在Huh7和L02细胞中存在大量差异性甲基化CpG位点及基因，Huh7细胞中可检测到大量抑癌基因DNA的异常高甲基化，提示DNA异常甲基化与肝细胞癌的发生发展密切相关。

肝细胞癌； 甲基化谱； 生物信息学分析

原发性肝癌（primary liver cancer，PLC）是我国常见的消化系统恶性肿瘤，2015年我国PLC新发病例约为46.6万人，发病率位列全部恶性肿瘤第4位，全年死亡病例约为42.2万，致死率位列全部恶性肿瘤第3位［1］。肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）是PLC最常见的类型，导致HCC发生发展的因素有很多，如慢性病毒性肝炎、酒精性肝硬化、黄曲霉素的摄入等，但其具体发病机制仍不明确，因此，研究其发生发展机制对寻找其新的治疗方案至关重要。……