转基因鲤鱼与对照鲤肠道微生物群落差异研究

饶刘瑜　李学梅　李星浩　朱文根　余育和　颜庆云

(1. 中国科学院水生生物研究所, 中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室, 武汉 430072; 2. 中国科学院大学, 北京100049; 3. 中国水产学院长江水产研究所, 农业部淡水生物多样性保护重点实验室, 武汉 430223;4. 中山大学, 环境科学与工程学院, 广州 510275)

鱼类肠道中寄居着复杂多样的微生物菌群, 它们共同构成了一个重要的功能单元, 也被称为宿主特定的“器官”, 并与宿主相互依存、互利共生[1,2]。鱼类肠道中微生物菌群的形成过程十分复杂, 且在不同的生长发育阶段, 微生物组成和数量也有规律地进行演替, 也会因鱼类所生活的水环境以及摄食条件等不同而有所差异[3,4]。水体中残留的农药、抗生素, 以及养殖过程微生物制剂的使用等也可对鱼类肠道中的微生物菌群结构造成一定的影响[5,6]。此外, 由于种类、年龄、基因等因素的影响, 不同的鱼类肠道微生物组成也不同。目前已经证实, 宿主基因型是影响高等哺乳动物肠道微生物群落组成的重要因素之一[7,8], 而对于低等脊椎动物的研究较少。Ley等[9]通过研究小鼠发现, 亲子代之间、子代个体之间的盲肠微生物菌群组成结构相似, 而无血缘关系的小鼠在属水平上存在明显不同。Zoetendal等[10]通过比较不同人群粪便中微生物群落16S rRNA基因序列发现, 双胞胎肠道微生物的相似性远高于夫妻之间或完全不相关的2个个体。本研究以转“全鱼”生长激素基因鲤为研究对象, 采用454高通量测序……