基于高覆盖（磷酸化）蛋白质组对人胚胎干细胞干性维持调控网络的解析

赵文娟，臧佳音，刘俊华，陈跃磊，丁小燕，杨冬，贺福初

1.军事科学院 军事医学研究院 生命组学研究所，国家蛋白质科学中心·北京，北京蛋白质组研究中心，蛋白质组学国家重点实验室，北京 102206；2.中国科学院 上海生命科学研究院 生物化学与细胞生物学研究所干细胞库，上海 200031

胚胎干细胞（embryonicstemcells，ESC）作为一种多能干细胞，可以分化成多种谱系细胞[1]。通过转录组学、表观遗传学和功能研究，对ESC多能性和自我更新的分子机制已得到相对充分的认识[1-3]，其中信号转导和转录调控发挥着重要作用。已知信号转导和转录调控与蛋白水平和翻译后修饰水平直接相关，因此利用蛋白质组学（尤其是翻译后修饰组学）数据进一步探索其机制具有重要的理论意义和潜在的应用价值。

蛋白质磷酸化修饰负责调控蛋白质功能、亚细胞定位和相互作用以及蛋白质稳定性，通过调控信号转导[4]、基因表达[5]以及蛋白激酶驱动的信号网络[6]，影响细胞周期[7]、细胞增殖、分化、凋亡等重要生物学过程。ESC（磷酸化）蛋白质组的鉴定，对于全面认识ESC多能性和自我更新相关的核心调控网络至关重要。然而，以前的研究由于技术水平的限制，并没有得到较全的ESC（磷酸化）蛋白质组[8-11]。随着磷酸化肽段富集技术及质谱技术的快速发展，蛋白质磷酸化修饰的质谱鉴定已向高精度、高灵敏度、快速扫描的方向不断进步。在本研究中，基于目前最高水平的磷酸化肽段富集和高精度质谱鉴定技术，我们得到目前较大的H9细胞（磷酸化）蛋白质组数据集，并对多能性维持相关的调控网络进行了解析。……