长白落叶松形成层差异表达的miRNA1)

魏佳玉　张素芳　刘紫怡　张海胤　付粱晨　杨树云　张磊

(林木遗传育种国家重点实验室(东北林业大学)，哈尔滨，150040)

MicroRNA(miRNA)是一类由内源基因编码的长度约在18～24个核苷酸的非编码单链RNA分子，主要参与转录后水平基因表达的调控，其结构很保守，所以可以通过生物信息学的方法来预测miRNA和其靶基因。自从2002年在拟南芥(Arabidopsisthaliana(L.)Heynh.)中发现植物中第一个miRNA后[1]，截止到2017年目前为止，曼彻斯特大学和剑桥大学组建的miRBase数据库miRBase(18.0)公布了223个物种的28 645条miRNA前体序列，35 828条成熟序列，但是绝大多数是被子植物，裸子植物只有火炬松(PinustaedaL.)和云杉(Piceaaspoerata)等少数物种的miRNA信息被收录[2-3]。裸子植物miRNA信息的匮乏很大程度阻碍了其miRNA的研究进展，高通量测序技术的运用可帮助解决这个问题，特别对于基因组庞大、ESTs信息少的针叶树，Solexa测序可高通量、快速、有效的获取miRNA信息。

长白落叶松作为中国东北地区重要的经济、生态及主要的造林树种之一采用常规改良的方法获得的遗传增益随着改良周期的增加而降低，而且其遗传背景较为复杂，基因组庞大，对其生长发育等分子机理的研究比较落后，通过对长白落叶松不同发育时期的形成层样品的miRNA差异表达分析，找出可能参与调控长白落叶松生长发育过程的miRNA，从而为针叶树种分子育种的研究奠定基础。

1　材料与方法

形成层是木本植物位于木质部和韧皮部之间的一种分生组织，向茎的中轴方向分裂而形成新的木质部细胞，向外分裂形成新的韧皮部细胞，大量……