李瑞强:诺禾致源与CIP共同推进马铃薯基因组国际化发展

2019-06-17 01:26李增安
中关村 2019年6期
关键词:基因组学基因组马铃薯

李增安

专栏导语:

近几年来,为更好地服务海归创新创业者,北京海外学人中心与本刊合作设立“海归新时代”专栏,迄今已报道了近百位海归科学家、企业家和用人单位,使得海外高层次人才的创新成果被广为人知。北京海外学人中心自成立以来,积极引进海外专家,引导高端科技创新人才汇聚北京科技创新中心建设,还在“一带一路”科技交流合作进程中发挥了重要作用。一批海外高层次人才,以北京海外学人中心为桥梁,陆续回国,在北京这片创新的沃土精耕细作,并取得了丰硕的成果。随着“一带一路”倡议的提出,一批海归创业团队纷纷参与到“一带一路”建设当中,为“一带一路”画卷添上了浓墨重彩的一笔。与此同时,一批引进海外高层次人才的科研院所也踊跃践行北京市“一带一路”国家人才培养基地项目,为沿线国家培养了亟需的专业学科人才,推动实现了民心相通的目标。在本期专栏中,将继续报道由海归专家李瑞强创办的北京诺禾致源科技股份有限公司及聚集一批海外英才的北京碧水源科技股份有限公司在“一带一路”沿线市场的创新实践和创业图景,他们在生命科学和环保领域为推动建设“人类命运共同体”做出的积极贡献。

随着“一帶一路”倡议变成全球共识,越来越多的企业、机构投身到这项具有深远意义的全球创新合作当中,积极发展与沿线国家的经济合作伙伴关系。尤其是一批又一批的中国高新技术企业充分发挥中国领先的科研优势,造福沿线国家人民,为推动构建人类命运共同体贡献出自己的一份力量。

在生命科学研究领域,由海归专家李瑞强创建的北京诺禾致源科技股份有限公司(以下简称“诺禾致源”)就是其中的卓越代表。

2015年7月25日,国际马铃薯研究中心(英文简称为“CIP”)在秘鲁利马与诺禾致源建立了战略合作伙伴关系。

国际马铃薯研究中心作为全球化农业研究与发展组织,拥有全世界最大的马铃薯基因库。而诺禾致源是全球领先的基因组学服务提供商。此次双方合作的内容是对马铃薯基因组进行测序。

未来,随着人口增长对粮食需求的不断增加、气候变化对农作物造成的减产影响,农作物生长将会面临诸多挑战。有农业专家认为,要想应对以上危机,对其品种进行改良是一条重要而有效的路径。而品种改良的第一步,就是要对农作物基因组进行测序,从而找出最优基因,这也正是诺禾致源的优势所在。

基因领域创业大有可为

“技而优则创”可以概括近十几年来李瑞强的生命轨迹。

与其他技术精英一样,李瑞强在忘我的科研中,不断斩获基因组学创新成果,之后凭借远大的梦想投身于创业的大潮。伴随一路“披荆斩浪”,他创办的诺禾致源如今已成长为中国基因测序领域的佼佼者。

时光回溯至2002年,本科毕业于东南大学应用物理系的李瑞强,进入华大基因工作,从事基因组与生物信息学研究。凭借出色的工作能力,两年后他远赴英国Sanger 基因组中心访问学习。2010年,他获得了丹麦哥本哈根大学生物学博士学位。

在华大基因工作期间,针对基因组学和生物学研究的需要,李瑞强开发了一系列测序数据分析软件,极大地推动了新一代测序技术的广泛应用,他本人也成为新一代测序数据分析技术发展的主要驱动者之一。

高通量短序列测序组装软件的开发成功,更让他开创了新测序技术在动植物基因组图谱绘制方面应用的新尝试。在他主持的第一个示范性项目——大熊猫基因组测序项目完成后,已经有数百个基因组采用了这一高效低成本技术方法。迄今为止,已经有约30个基因组完成了绘制工作。

在华大基因近十年的工作历练,让李瑞强取得了非凡的科研业绩。先后主持和参与了多项基因组计划,包括水稻基因组完成图、家蚕基因组框架图和完成图、第一个中国人基因组图谱、黄瓜基因组、大熊猫基因组、国际千人基因组、马铃薯基因组、玉米核心种质测序等。凭借在这些大型研究计划中所展现的出色的科学研究能力、沟通协调能力和团队领导力,李瑞强从程序员一路升任为项目组长、生物信息部主任、科技合作事业部总裁、公司副总裁,负责公司科学研究和科研合作领域工作。

伴随而来的是,李瑞强从程序员一路升任至科技合作事业部总裁、公司副总裁,负责公司科学研究和科研合作领域工作。

近几年来,基因组学在国内迅速发展,并越来越多地应用扩展到其他领域。在此背景下,李瑞强敏锐地感知到,“在基因领域创业将大有可为,如果错过了,实在太可惜”。

怀着强烈的事业心,以及对行业发展的前瞻性,他走上了一条创业不归路。

2011年初,李瑞强为了实现自己的梦想,争取更大的发展空间,毅然辞去了华大基因的高管职务。同年3月,他在北京中关村生命科学园注册成立了诺禾致源生物信息科技有限公司。

诺禾致源,英文名为Novogene。其中,名字的前半段为拉丁文“Novo”,中文译为“创新”,英文“de novo”是“重新”的意思,而后半段“gene”翻译过来是“基因”。由此来看,诺禾致源包含了“创新”、“测序”、“基因”三层含义,由此彰显出李瑞强创立诺禾致源的初心。

“一个每天都在与生命打交道,每天都会让人充满好奇心,并且投入到忘我的行业”。这是李瑞强给基因行业下的定义。

也正是凭借这一理念,他找到了一批志同道合的事业“合伙人”,共同携手克服了创业中的很多困难。

据他回忆,“刚创业时,团队只有5个人,每个人都身兼数职,吃住都在公司。我们每天都为办理公司的各项手续和联系客户奔波不停,也遇到过很多意想不到的困难。”

但是,经过不懈的努力,当年8月,诺禾致源团队拿到了四川农业大学委托给他们的藏猪基因组测序研究项目,这是他们创业以来的第一单大生意。

为了保证高质量地完成这个项目,李瑞强决定找一个条件更好的实验室开展实验。经历一番辛苦的探寻后,他们最终决定在中国农业科学院作物研究所的实验室完成这一项目试验。不过,他们只能在周末加班加点,熬通宵地赶实验。

经过两年的不懈努力,2013年10月,他们出色地完成了这个项目,得到了各方面的高度认可。李瑞强也以这个项目的研究结果,发表了题为《比较基因组学鉴定藏猪和家猪的自然和人工选择》的论文,并刊登在国际著名学术杂志《自然》的子刊《自然—遗传》上。

与此同时,诺禾致源与中科院动物所合作启动了地山雀基因组项目。他们利用Illumina深度测序,组装出了长度为1.08Gb的地山雀基因组序列图谱,并对其近缘物种大山雀、黄颊山雀及黑尾地鸦进行重测序,从全基因组水平明确了地山雀的分类问题。这一研究,填补了高原鸟类基因组及分子生物学研究的空白。2013年7月,该研究成果在学术杂志《自然-通讯》上发表。

从此以后,公司运作走向正轨,并快速发展壮大,在同行业中做到了国内市场占有率第一。

诺禾致源在成立之初,致力于开展农业分子育种相关的科技服务工作。后来,随着行业的发展和市场的转变,公司调整了业务方向,开始专注于开拓前沿分子生物学技术和高性能计算在生命科学研究和人类健康领域的应用。

在此期间,李瑞强提出了公司发展的宏大愿景,即“致力于成为全球领先的基因组学产品和服务提供者”。

2014年12月,公司团队在《Nature Genetics》期刊發表金丝猴基因组文章,在《Nature Bioechnology》期刊发表大豆泛基因组文章。同年,诺禾致源美国全资子公司和英国全资子公司先后成立。

李瑞强说,诺禾致源的发展是多头并进的,他们从 2012年就开始做肿瘤基因检测服务,并多次购买Illumina HiSeq X Ten。现在,已成为全球最大的基因测序平台之一。

2015年,诺禾致源获得了首轮2亿元额度的国投创新融资。当年,其科技服务的国内市场收入达到3.5亿,成为业内最大的科研服务提供商。

2016年,诺禾致源获得了5亿元B轮融资。该轮融资后,诺禾致源估值已达70亿元。公司改制成为诺禾致源科技股份有限公司。之后,诺禾致源将业务拓展至新加坡地区,与AITbiotech共建了新加坡合资公司,从而提升了新加坡地区超大规模测序能力。

2018年3月,诺禾致源美国临床检查实验室获得CLIA认证。5月,诺禾致源英国剑桥实验室成立。

诺禾致源的飞速发展,除了测序平台、融资数额、测序规模、科研能力,它的团队背景更令人赞赏不已。李瑞强说,“公司的发展需要资本,没有资本不行,但是光有资本也不行,人才是企业发展的根本动力。”

的确,公司从最初的几个人到现在近2000人的团队,可以看出其业务发展是快速的,同时团队的成长也是迅速的。诺禾致源业务也从最初的科技服务,到现在覆盖了科技服务、肿瘤基因检测及遗传检测三大领域。

如今,诺禾致源现已建立起一支来自海内外顶级名校、多学科交叉型的高素质综合团队,其中硕士及以上学历员工占比60%以上。公司建立了通量规模领先的基因测序平台和高性能计算平台,有效地支撑着生命科学研究和医疗健康两大领域对大数据分析和存储的需求。业务覆盖全球6大洲超过50个国家和地区,服务客户超过2000家,成为基因测序科研服务领域的领先企业。

诺禾致源在全球范围内与众多学术机构建立了广泛的合作关系,完成了多项具有国际先进水平的基因组学研究工作。截至2019年4月,诺禾致源与项目伙伴合作发表SCI文章总计400余篇,累积影响因子大于2626;已取得软件著作权149项,专利22项;合作伙伴遍布全球,包括超过1920家科研院所和高校、720余家医院、1430余家医药和农业企业等。

诺禾致源与CIP合作

随着公司的快速壮大,诺禾致源积极响应国家“一带一路”倡议,从2015年开始进行海外市场布局,目前已在美国、英国、新加坡建有实验基地,并积极开发“一带一路”沿线国家市场,希望能有更多的合作项目。

2015年7月28日至30日期间,第九届“世界马铃薯大会”在北京召开。会议期间,国际马铃薯研究中心与诺禾致源建立了战略合作伙伴关系,致力于对数种马铃薯基因组进行测序,为马铃薯基因改良奠定基础。

马铃薯是世界上仅次于小麦、水稻、玉米之后的第四大粮食作物,原产于南美洲安第斯山区,人工栽培历史最早可追溯到大约公元前八千年到五千年的秘鲁南部地区,也是重要的蔬菜作物。基因改良的做法,可以比传统育种更快地提高马铃薯的品种产量、品质和抗病性等优良性状。这对人类的生活和生存,起着至关重要的作用。

CIP始创于1971年,总部位于秘鲁利马。这一机构致力于通过根块茎作物的研究,提供可持续的解决方案,以应对饥饿、贫穷、营养不良和自然资源退化等紧迫的世界问题。中心还设有信托委员会,是世界上马铃薯种植资源最多的机构。

此次CIP与诺禾致源的合作,就是对九种不同栽培型马铃薯和一种近缘野生型马铃薯进行基因组测序。诺禾致源利用公司卓越的生物信息学技术和丰富的基因组学项目经验对测序获得的数百万条序列进行组装,并与已有的马铃薯参考基因组做比对,如果这些基因与重要性状相关,如抗逆(病、虫、旱、冻、盐等)性、早熟或高产等,将会成为重要的作物改良基因资源。

对于这一合作,双方都充满了信心和期待。

世界马铃薯大会总负责人及主讲人威尔斯表示,“双方将会显著地推进马铃薯基因组学研究,并将有可能得到新的基因序列信息。”CIP基因库主任大卫·埃利斯认为,“我们已经看到基因组学技术在农作物育种方面所带来的机遇与挑战。”

现在,马铃薯的时代已经到来了!

双方经过一年多的努力,已按期完成了马铃薯复杂基因组序列的组装和比对,揭秘了未知基因,以期能有优良性状相关,成为重要的作物改良基因资源。CIP对诺禾致源所拥有的领先技术与丰富经验高度认可,期望后续能有更多的合作。诺禾致源与CIP的战略合作,将先进的基因组学技术高效率地应用于农作物的重要基因资源开发,以CIP广泛的基因库为基础,对未来全球作物的育种与生产工作产生积极的影响。

李瑞强总结道,“诺禾致源拥有一个年轻、高效、有创新精神的团队。公司年轻人比较多,科研氛围非常活跃,新的观点和新的想法比较容易产生,团队合作协同效率高,沟通效率也很高。这次在与CIP合作项目中,就充分发挥了团队基因组学方面的专业性、沟通高效性和科研的创新性,才使得合作项目顺利完成。”

“未来的诺禾致源,将继续致力于开拓前沿分子生物学技术、高性能计算技术在生命科学研究和人类健康领域的应用,使最前沿的科学技术惠及于民。”李瑞强说。

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