EGFR蛋白的生物信息学初步分析

刘一凡

摘 要：EGFR（Epidermal Growth Factor Receptor）是表皮生长因子受体（HER）中的一种重要蛋白，属于EGF（Epidermal Growth Factor）家族。作为一种跨膜蛋白，其信号通路对细胞多种生理过程起重要作用。本文中从该蛋白的氨基酸组成、亲水性分析、系统发育分析，亚细胞定位，三级结构模拟等多个方面对该蛋白进行了生物信息学分析，这些结果有助于我们更进一步地了解EGFR蛋白的结构与功能。

关键词：EGFR；生物信息学；初步分析；EGFR蛋白；系统发育分析；亚细胞定位预测；三级结构预测

EGF以及其受体于1953年由范德堡大学的Stanley Cohen教授发现。Cohen教授因此与意大利的Rita Levi-Montalcini共享了1986年诺贝尔医学奖。在许多癌症病例中，影响EGFR表达或活性的突变是癌症的重要诱因。导致EGFR过度表达的突变被证明与多种癌症的产生有关。其中包括肺部鳞状细胞癌（80%有关），肠癌、恶性胶质瘤（50%有关）与头颈部上皮肿瘤（80%至100%有关）。[1]上述与癌症有关的突变与EGFR的联系主要体现在前者能导致EGFR保有异常的持续活性，间接引发不受控制的细胞增殖与分化。对EGFR的抑制是当前开发相关癌症疗法的一个重要发展方向。研究EGFR蛋白质的结构是研究EGFR的作用机理、信号传递和抑制方法的基本。本文从氨基酸组成分析、系统发育分析、亚细胞定位预测和三级结构预测四个方面对EGFR的结构做了研究和探讨，以期为EGFR及其致病机理的研究和相关癌症治疗方法的开发提供参考。

1 材料与方法

1.1 材料

从uniprot[2]上下载EGFR蛋白氨基酸序列（FASTA格式），以人的EGFR蛋白序列为例：

>sp|P00533|EGFR_HUMAN Epidermal growth factor receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EGFR PE=1 SV=2

1.2 方法

1.2.1EGFR氨基酸组成分析

利用Bioedit进行氨基酸分析。B……