HDAC9基因多态性与东北地区汉族人群脑梗死的相关性分析

2020-09-15 15:57靳美宋培芸曹利
健康大视野 2020年17期
关键词:基因多态性脑梗死

靳美 宋培芸 曹利

【摘 要】 目的:探讨组蛋白去乙酰化酶9(HDAC9)基因单核苷酸多态性(SNP)与东北地区汉族人群脑梗死的相关性。方法:实验采用病例-对照方法,随机选取符合研究目的的汉族脑梗死患者201名及汉族健康者139名。采用聚合酶链式反应-连接酶检测反应(PCR-LDR),对所有受试者HDAC9 基因rs2107595位点进行基因分型,统计分析比较病例组和对照组不同基因型(TT/CT/CC)及等位基因(C/T)的差异,并以OR(95%CI)值表示等位基因(C/T)的相对风险。结果:HDAC9基因rs2107595C/T位点,病例组TT基因型及T等位基因频率明显高于对照组,差异具有统计学意义(χ2=7.511,P=0.022),T等位基因携带者患脑梗死的风险增加(OR=1.490,95% CI:1.081~2.051)。结论:HDAC9 基因 rs2107595 位点 SNP 与脑梗死易感性相关,其中 T 等位基因可能为脑梗死的遗传易感基因。

【关键词】 HDAC9、基因多态性、脑梗死

【中图分类号】 R743.3   【文献标志码】B   【文章编号】1005-0019(2020)17-199-02  脑梗死是一种异质性综合疾病,环境因素和遗传因素的交互作用在发病中具有重要的作用[1]。基因 HDAC9 是在全基因组测序研究中发现的与脑梗死发生密切相关的基因,我们通过对脑梗死患者基因 HDAC9 rs2107595位点多态性的研究,揭示表观遗传学中遗传变异因素在脑梗死发病过程中所起到的作用。

1 对象与方法

1.1 对象 实验组为黑龙江省医院 2017 年 1 月至 2019 年 6 月神经内科 201名脑梗死住院患者,所有研究对象均满足人体试验伦理学标准,且已签署知情同意书。实验组纳入的标准:(1)患者均符合第四届中国脑血管疾病学术会议关于脑卒中的诊断标准;(2)拥有东北地区户籍并且在东北地区内居住年数大于 5 年:(3)民族为汉族。排除标准:1、患者既往史中有心脏、肾脏、肝脏、骨骼和癌症等主要疾病的,以及艾滋病,梅毒等严重传染病史;2、排除患者之间存在血缘关系。

对照组为黑龙江省医院体检中心2017年1月至2019年6月健康体检者139名,排除既往曾有脑卒中、脑外伤、脑血管病,排除曾有心脏、肾脏、肝脏、骨骼和癌症等主要疾病的,以及艾滋病,梅毒等严重传染病史,排除存在神经功能明显的缺陷者,对照组均满足人体试验伦理学标准。

1.2 方法 清晨空腹肘前静脉抽取5ml血样,置于EDTA抗凝管后保存在-80℃冰箱中。应用Axygen公司的AxyPrep-96全血基因组DNA试剂盒提取基因组DNA,置于-80℃冰箱保存备用。使用ABI 公司PRISM3730 电泳测序仪对LDR反应产物进行测序,通过Genemapper 软件进行数据分析,根据不同峰型及碱基大小进行基因分型。

1.3 统计学分析 使用SPSS 22.0软件进行统计分析,不同基因型(TT/CT/CC)及等位基因(C/T)等变量属计数资料,采用频数及百分比表示,使用χ2检验比较病例组和对照组间上述资料的差异,并以 OR(95%CI)值表示等位基因(C/T)的相对风险。

2 结果

病例组及对照组 HDAC9 基因rs2107595位點基因型分布均符合Hardy-Weinberg 遗传平衡定律(病例组 P=0.273,对照组 P=0.919;认为P>0.05符合Hardy-Weinberg 平衡),故本研究中病例组及对照组均有较好的群体代表性。结果显示病例组 HDAC9 基因rs2107595 T/C位点TT、CT、CC基因型频率与对照组比较,差异具有统计学意义(P <0.05)。病例组T等位基因频率明显高于对照组,T等位基因携带者患脑梗死的风险增加(表 1)。

3 讨论

随着分子生物学研究的深入,遗传学、表观遗传学以及环境因素受到广泛关注。最近的全基因组关联研究(GWAS)表明HDAC9基因与脑卒中有关,但可靠性仍存在争议,尤其是来自不同种族和地理位置的数据。GWAS报道HDAC9基因3端 SPN rs2107595多态性与大动脉脑卒中风险相关[2]。HDAC9缺失可能导致炎症基因的下调,脂质相关基因的上调,以及小鼠动脉粥样硬化病变大小的显著减少[3]。大多数学者表明 rs2107595 仅增加大血管动脉粥样硬化性卒中风险。然而Akinyemi[4]研究非洲人群 rs2107595 多态性也会增加小血管脑卒中风险。Su[5]研究 rs2107595 与南方汉族人群脑卒中关系,在加性、显性、隐性和等位基因模型无显著相关性,表明 rs2107595多态性与脑梗死无关联。

本研究发现 HDAC9 基因 rs2107595T/C位点与脑梗死的发病可能存在相关性,其中T等位基因可能为脑梗死的遗传易感基因,进一步提示HDAC9基因rs2107595 T/C位点与脑梗死易感性的关联。

同时本研究存在一定局限性,该研究为基于医院的病例对照研究,不能排除有选择偏倚的可能性。并且,研究结果不应被推断适用于其他人群,因为该研究群体均为居住于中国东北地区的汉族人群。

综上所述,本研究提供的数据表明,HDAC9 基因rs2107595 T/C 位点可能与脑梗死的疾病易感性相关。但有关该基因位点与疾病易感性之间的具体病理生理功能及发病机制仍有待进一步的研究。

参考文献

[1] Monitoring Tobacco Use and Prevention Policies: Perspective of WHO Report on the Global Tobacco Epidemic, 2017[J]. Journal of Nursing Science & Practice,2019,9(2).

[2] Jun S,Pierce A,et al.Extracellular superoxide dismutase polymorphism in mice[J].Arterioscler Thromb Vasc Biol.2003 Oct 01; 23(10) :1820-1825.

[3] Weber C, Noels H.Atherosclerosis: current pathogenesis and therapeutic options[J]. Nat Med. 2011 Nov 7; 17(11):1410-1422.

[4] Pearce WJ. Epigenetics: an expanding new piece of the stroke puzzle[J]. Transl Stroke Res. 2011 Sep; 2(3):243-247.

[5] Vidigal JA, Ventura A. The biological functions of mi RNAs: lessons from in vivo studies[J]. Trends Cell Biol. 2015 Mar; 25(3):137-147.

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