宏基因组二代测序在非HIV重症肺孢子菌肺炎患者中的应用

梁艳 方婉娜 王天立 邹叶强

耶氏肺孢子菌(Pneumocystis jirovecii，PJ)是一种机会感染性病原体，可引起致命性的肺孢子菌肺炎(Pneumocystis pneumonia，PCP)。肺孢子菌感染多见于HIV感染、器官移植术后及长期应用激素治疗等免疫低下患者，也可在免疫力正常的机体内定植[1]。随着化疗药物、免疫抑制剂的广泛使用，非HIV患者肺孢子菌肺炎发病率呈现增高趋势。临床多以发热、干咳和进行性呼吸困难等为主要症状，严重者可导致急性呼吸窘迫综合征(ARDS)，临床病死率高达30%～50%以上。所以及时诊断和启动PCP特异性治疗是降低病死率的关键。但PCP的早期病原学诊断存在困难，传统方法是将肺泡灌洗液(BALF)行特殊染色以查找肺孢子虫包囊或滋养体，其在检测时间、阳性率方面存在局限性，容易延误诊治。

宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing，mNGS)可以直接从临床标本中提取全部微生物的DNA和/或RNA进行测序，包括病毒、细菌、真菌、寄生虫[2]。mNGS 技术被广泛应用于感染性疾病的研究，在血液、脑脊液、BALF中提示出良好的诊断性能[3]。多数常规培养不易获得的寡养细菌、真菌、病毒等病原体可以通过mNGS检测从呼吸道标本中检出[4，5]。现将我院2020年6～12月收治于呼吸重症监护病房的4例非HIV感染重症PCP患者的临床资料报道如下，以进一步评估mNGS在临床工作中的应用价值。

1 病例资料

1.1 病例1男，72岁，既往有间质性肺炎、炎性肌病、2型糖尿病，泼尼松片口服2月余(30mg/d)、冠心病。因气促、发热3d入院。院外体温最高38.0℃，咳白痰，伴气促、乏力、心慌，当地医院肺部CT示双肺炎症，给予头孢克肟0.1g tid 口服抗感染治疗，患者症状加重遂入我科ICU。……