rRNA二级结构在黏孢子虫研究中的应用

谭禄奇

（重庆师范大学 生命科学学院，重庆 401331）

2006年诺贝尔生理或医学奖授予美国斯坦福大学医学院的安德鲁·菲尔（Andrew Fire）和麻省理工大学医学院的克雷格·梅洛（Craig Mello），以表彰他们发现RNA双链能引发基因沉默[1]，这使得学者们关注到RNA在生物信息上的重要作用，并开始研究RNA分子的结构与功能之间的关系。

目前的黏孢子虫研究中，主要是利用核糖体RNA（Ribosomal RNA，rRNA）的一级结构结合形态学对物种进行鉴定和分类，利用rRNA序列进行生物信息比较和推测黏孢子虫物种和类群之间的系统发育关系。rRNA二级结构已被广泛应用于多个领域，但在黏孢子虫的研究中只有部分学者应用。本文将rRNA二级结构及其在黏孢子虫中的应用进行综述，以期为以后的黏孢子虫研究提供参考。

1 rRNA二级结构特征

rRNA二级结构是由其一级结构通过A-U和G-C配对，自身回折形成双链和环状结构以及部分单链组合形成的平面结构。rRNA的二级结构比其一级结构（序列）更加保守，不同的同源rRNA序列可能有相同或相似的二级结构，只要原有的碱基互补情况没有变化，其二级结构就会较为稳定。但也有可能在一级结构中少数的碱基改变导致碱基互补改变，在二级结构中引起本质性的差异。

rRNA的功能往往与其结构有着密切的关系。rRNA二级结构是形成rRNA三级结构的基础，是通过其一级结构了解其三级结构和更高级结构的一个途径，进而了解rRNA结构与功能的关系。通过对RNA结构研究已经证明，RNA二级结构中的许多环状结构与RNA的功能密切相关，而rRNA也不例外。……