于勇,朱欣娜,张学礼
(中国科学院天津工业生物技术研究所,天津 300308)

通过合成生物学技术构建微生物细胞工厂,能够将糖类等可再生的生物资源转化为多种大宗化学品,实现大宗化学品的绿色清洁生产,可以摆脱对石油资源的依赖,解决石化制造过程中的高耗能和高污染问题,对促进国民经济可持续发展至关重要[1]。本文对微生物细胞工厂构建技术、代谢调控机制及大宗化学品生物制造的典型案例进行了综述,并对细胞工厂的未来进行了展望。
基因组编辑技术是细胞工厂代谢途径构建及优化的重要技术。通常的基因编辑技术有:Red同源重组技术[2-3]、锌指核酸酶技术(zinc-finger nuculeases,ZEN)[4]、转录激活因子效应物核酸酶技术(transcription activator-like effector nucleases,TALEN)[5]等。这些基因编辑技术在合成生物学的发展中具有“里程碑”式的意义,但存在耗时长、成本高及宿主局限性等缺陷,无法满足高效构建细胞工厂的需求。
CRⅠSPR/Cas (clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRⅠSPR-associated proteins)基因编辑技术具有操作简单、基因编辑效率高、成本低廉等优势,近年来得到了深入的开发,并广泛应用于生物及医药领域。在大宗化学品代谢途径构建和改造中,CRⅠSPR/Cas 基因编辑技术显示了广泛的适用范围,成功地应用于大肠杆菌、谷氨酸棒杆菌、丙酮丁酸梭菌、链球菌、芽孢杆菌等原核微生物及酿酒酵母、曲霉等真核微生物细胞工厂的构建[6-7]。
首先,CRⅠSPR/Cas 技术可成功地应用于基因表达强度的调控。Heo 等[8]将该技术用于丁醇代谢途径的改造,通过高效编辑大肠杆菌柠檬酸合成酶基因(gltA)的启动子区域降低该基因的表达强度,将柠檬酸合成酶的活性调整为出发菌的55%,将丁醇的产量提高了1.3倍。……