2株鸡细小病毒全基因组序列测定与分析

高倩文，王君娜，张宇名，尹燕博，徐守振

(青岛农业大学动物医学院，山东 青岛 266109)

鸡细小病毒(Chicken parvovirus，ChPV)是一种无囊膜的单链DNA病毒，基因组长约为5 000 kb，包括3个开放阅读框(ORF)。ORF1编码非结构蛋白(NS)，ORF2编码衣壳结构蛋白(VP1和VP2)，而位于ORF1和ORF2之间的ORF3编码假定蛋白(NP)，其功能目前尚不清楚[1]。ChPV是引起鸡肠道疾病重要的病原体之一，能引起禽肠炎综合征和发育障碍与矮小综合征等疾病。临床特征表现为腹泻、精神沉郁、发育迟缓、体重增加减慢、上市时间增加 ； 更严重的能导致免疫功能障碍和死亡率增加[2-3]。已有研究表明,该病在鸡群中普遍存在，主要侵害雏鸡，以商品肉鸡的感染率较高，种鸡和蛋鸡次之[4]。迄今为止，已有39株完整的ChPV基因组序列在GenBank中提交，1株来自匈牙利[5]，4株来自美国[6]，5株来自韩国[7]，29株来自中国广州[8]。目前，虽然致病毒株仍未确定，但是ChPV在鸡群中的流行率却仍在增加。本研究将测序的2株ChPV完整的基因组编码序列与来自不同地区参考株的基因组序列进行同源性和遗传进化分析，为ChPV基因组来源和遗传进化特征提供参考，有助于更好地防控ChPV引起的有关疾病。

1 材料与方法

1.1 病料 本实验室检测的ChPV阳性病料分别来自山东潍坊和河南濮阳某养鸡场，病鸡表现腹泻、体重减轻、发育迟缓等临床症状。

1.2 主要试剂和仪器PremixTaqTM、pMDTM18-T Vector Cloning Kit、DL-2 000 DNA Marker,均购自宝生物工程(大连)有限公司；病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒，购自天根生化科技(北京)有限公司；微量琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒,购自康为世纪生物技术有限公司。高速离心机Pico17型,购自ThermoFisher公司；……