张 娟, 陈茂培, 董良庆, 林友培, 潘教孟, 宋国贺, 阿晔岭, 张 舒, 高 强, 任正刚
复旦大学附属中山医院肝癌研究所,复旦大学癌变与侵袭原理教育部重点实验室,上海 200030
近年来,美国癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析计划(Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium, CPTAC)、癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)、国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium,ICGC)等大规模肿瘤研究计划的开展,及基因组、转录组、蛋白质组、免疫蛋白组学和生物信息学等组学技术的发展,快速地推动了肿瘤免疫的相关研究。肿瘤-睾丸抗原(cancer-testis antigen,CTA)是一类限制性表达在生殖细胞,而在其他正常人体组织中不表达或低表达,在多种肿瘤中异常表达的肿瘤相关抗原。生殖细胞不表达主要组织相容性复合体Ⅰ(major histocompatibility complex,MHC-Ⅰ),且天然存在的血睾屏障共同导致CTA基因产物不能与正常人的免疫系统接触,较少引起自身免疫反应,故CTA可作为肿瘤免疫治疗的理想靶点。1991年,研究人员[1]利用T细胞表位克隆技术在黑素瘤中发现第一个CTA:黑素瘤抗原A1(melanoma antigen-A1,MAGE-A1)。目前,已有276个CTA基因被发现,但几乎所有关于CTA的研究都仅限于mRNA表达水平。本研究首次从多组学鉴定肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中免疫治疗的新靶点联蛋白α2(catenin alpha 2,CTNNA2), 并探讨其作为HCC免疫治疗靶标的可行性。
1.1 一般资料 收集2013年至2015年复旦大学附属中山医院收治159例手术切除的HCC患者的新鲜标本,所有病例均经病理诊断证实。其中,男性128例,女性31例,年龄20~81岁,平均年龄为54岁。每例患者的手术标本在肝癌术后分别取癌组织和癌旁组织,并立即经液氮速冻后置液氮中保存,以备转录组测序技术(RNA sequencing,RNA-Seq)、串联质谱标签(tandem mass tag,TMT)定量蛋白组学、磷酸化组学富集及免疫蛋白组学和反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测。……