藜麦叶片响应低氮胁迫基因的可变剪接事件分析

2021-03-05 14:17:06杨利艳杨小兰朱满喜张玉荣杨雅舒王创云
湖南师范大学自然科学学报 2021年1期
关键词:差异分析

杨利艳,杨小兰,朱满喜,张玉荣,杨雅舒,王创云

(1.山西师范大学生命科学学院,中国 临汾 041000;2.山西农业大学农学院,中国 太谷 030800)

藜麦(ChenopodiumquinoaWilld)为一年生双子叶植物,苋科藜亚科藜属,是一种起源于南美洲安第斯区的古老物种[1]。藜麦种子富含无谷蛋白以及人体无法合成的8种必需氨基酸,且铁、钙、磷含量丰富,具有良好的营养健康效益[2,3]。藜麦不仅有极高的营养价值,还具有很强的抗逆性,因此受到世界的关注并被广泛引种,是未来最具潜力的农作物之一[4]。

氮元素(N)是细胞结构不可或缺的一部分,担负着植物的生长发育及机体调控的重要责任[5]。氮素约占植物干重的0.3%~5%,缺氮或低氮是导致农作物生长不良、减产的重要原因[6]。氮胁迫条件下,植物会通过根的伸长来增强氮的吸收[7],在甘蓝型油菜[8]、小麦[9]、水稻[10]中皆有报道。然而目前对藜麦低氮响应的研究鲜有报道。

可变剪接(alternative splicing,AS)是一种转录后调节机制。该机制可使蛋白的最终产物表现出不同的功能和结构特性,或者在相同的细胞中可能由于表达水平的不同而导致表型发生变化,因此对增强机体内转录组的可塑性、基因的表达以及蛋白质结构的多样性起重要作用[11,12]。目前,利用RNA-seq 技术对可变剪接的分析有不少报道,可变剪接基因(alternatively spliced genes,ASG)在一些生物中占较高比例,如人(95%)、线虫(71%)[13,14],在禽类[15]、甲壳类动物[16]中也发现了新的剪接变体。作为模式植物,拟南芥AS事件的发生比例也较高,为61%[17],约有42%的内含子参与拟南芥的生长发育及胁迫响应[18,19]。……

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