高通量测序分析蚕豆种子内生细菌的多样性

刘璐, 名晓东, 张晓艳, 郝俊杰, 付丽平, 王乾坤, 吕鑫, 陈旺, 刘全兰*

(1.青岛科技大学海洋科学与生物工程学院， 山东 青岛 266042; 2.青岛市农业科学研究院， 山东 青岛 266100)

蚕豆(ViciafabaL.)属豆科蝶形花亚科野豌豆族野豌豆属，起源于亚洲西南部和非洲北部[1-2]。蚕豆营养丰富，含有蛋白质、糖类、脂质、膳食纤维以及钙、铁、胡萝卜素、维生素等；蚕豆中含有人体中不能合成的8种必需氨基酸，其中赖氨酸含量较高[3]。蚕豆还有利湿消肿、清热健脾、促进骨骼生长的作用；其含有的脑磷脂和胆碱是大脑和神经组织的重要组成成分[4]。不仅如此，蚕豆还在饲料和绿肥领域具有广泛的用途，这些优点使蚕豆受到联合国粮农组织的支持发展。中国是蚕豆种植面积较大的国家之一，青海、甘肃和云南等省区是主要种植地区。张小娟等[5]分析了青海省不同生态区蚕豆主栽品种青蚕 14 中的6个根瘤菌株，发现它们分属 4 个菌属；Saïdi等[6]从蚕豆根瘤中分离了104株内生细菌，其中9株菌回接后可提高蚕豆的生物学产量，这些研究表明蚕豆中内生细菌含量丰富。

植物内生菌是指其生活史的一定阶段或全部阶段定殖于植物器官、组织内部、细胞间隙以及细胞内的微生物，一般分为内生细菌、内生放线菌及内生真菌等三大类[7- 8]。种子是植物重要的繁殖器官，具有重要的经济价值，也被证实携带有大量的微生物种群[9-11]。基于16S rDNA高通量测序研究种子内生细菌的相关工作已开展，结果表明，水稻种子内生细菌中门水平且丰度大于1%的优势菌群是变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和放线菌门(Actinobacteria)[12]；……