多个GEO芯片联合分析阿尔茨海默病内嗅皮层的关键基因

邵康梅，张 凡，蔡宏斌，魏海萍，陈圆圆，葛朝明*

(1.兰州大学第二医院神经内科，中国甘肃兰州730030；2.甘肃省消化系肿瘤重点实验室，中国甘肃兰州730030)

阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease，AD)是一种进行性神经退行性疾病，其发病机制可归因于大脑皮质和边缘区β淀粉样蛋白(amyloid β-protien，Aβ)斑块的胞外聚集和过度磷酸化的tau蛋白构成的细胞内神经原纤维缠结，其特点是记忆丧失和进行性神经认知功能障碍[1]。AD是老年期最常见的痴呆类型，占老年期痴呆的60%～80%[2]。目前，AD的治疗无特效药物，寻找AD早期的治疗靶点对疾病的治疗至关重要。研究证实内嗅皮层是AD进展中最早发生病变的部位[3～4]。

内嗅皮层位于颞叶内侧，参与最初的情景编码，在记忆形成过程中起着不可或缺的作用，而且是海马体和大脑皮层之间的关键通道[5]。AD中tau蛋白相关神经原纤维缠结病理遵循一定的顺序，首先影响内嗅皮层，然后发展到边缘系统和联合皮层[5]。因此，在AD早期针对内嗅皮层寻找其潜在治疗靶点，对AD的治疗具有重要的临床意义。

本研究收集了GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中AD的内嗅皮层表达谱数据集GSE-48350[6]、GSE26972[7]和 GSE118553[8]。通过批次矫正对多组数据联合分析，筛选出差异表达基因(differentially expressed genes，DEGs)，并对其进行GO(Gene Ontology)分析、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集分析以及蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction，PPI)网络分析，结果提示血管细胞黏附分子1(vascular cell adhesion molecule 1，VCAM1)基因、CD44、原癌基因FOS和富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白(secreted protein acidic and rich in cysteine，SPARC)基因在AD发生发展中发挥关键作用。VCAM1属于黏附分子免疫球蛋白超家族，在衰老中与记忆和认知密切相关[9～10]。CD44是一种跨膜糖蛋白，参与透明质酸代谢、激活淋巴细胞和释放细胞因子过程，并且参与海马记忆编码、存储或检索过程[11～12]。……