食管鳞癌免疫相关基因鉴定及miR-6806-5p靶标预测

刘志伟，李新阳，王子明，任 婧，王新帅

食管癌作为消化系统恶性肿瘤之一，死亡率高，严重威胁人类的健康[1]。《2018年全球癌症统计》对全世界范围内185个国家36种癌症的发病率及死亡率的估计显示，2018年食管癌新发572 034例，其发病率和病死率分别在全球恶性肿瘤中居第七位和第六位[2]。同时中国食管癌新发及死亡病例约占全球病例的一半，《2015年中国恶性肿瘤流行情况分析》显示我国食管癌新发24.6万例，死亡18.8万例，其发病率和病死率分别在中国恶性肿瘤中居第七位和第四位[3]。由于食管癌早期无明显症状，大多数患者确诊时已是晚期，无手术根治切除的机会，传统放化疗尚不能明显提高患者远期生存率，近年来免疫治疗的兴起使多种癌症患者受益，同时也为食管癌精准治疗提供了一种新的治疗方式。基于此，进一步探明更多影响食管癌免疫相关基因显得尤为必要。因此，本研究在转录组水平上通过对比分析食管鳞癌与正常组织的基因表达差异性，探寻食管鳞癌免疫相关基因，并验证其有效性，为食管鳞癌免疫治疗提供理论依据。现报道如下。

1 材料与方法

1.1 数据下载及预处理研究采用Rstduio(3.6.3版本)下载函数，从GEO数据库获得GSE75241基因表达矩阵及平台信息GPL5175[HuEx-1_0-st] Affymetrix Human Exon 1.0 ST Array[transcript (gene) version]。基因表达矩阵GSE75241共纳入15例食管鳞癌组织样本及15例癌旁组织样本，借助标准化函数降低数据间的差异性，使基因表达数据具有较好的一致性，基于平台信息将探针名转化为基因名以用于下一步分析。……