低深度全基因组测序技术联合核型分析在无创产前检测高风险孕妇产前诊断中的应用

徐晶晶，胡 月，刘 文，宋雅娴，彭亚琴，何国平，吴丽敏，汪 菁

无创产前检测技术(non-invasive prenatal testing, NIPT)的推广应用有效提高了染色体非整倍体异常的检出率，降低了人口出生缺陷率。但NIPT的筛查也存在一定的局限性，既存在一定的漏筛风险，也存在一定比例NIPT结果与产前诊断染色体核型分析结果不一致的情况，这其中一个重要原因是染色体核型分析的分辨率为5～10 Mb导致染色体的微缺失微重复无法被检测到。而随着高通量测序技术的发展，低深度全基因组测序技术(low-pass whole genome sequencing，Low-pass WGS)被逐渐应用于产前诊断中，该项技术能检测到100 Kb～5 Mb间的染色体微变异，能有效弥补染色体核型分析的不足。该研究对中国科学技术大学附属第一医院(安徽省立医院)165例NIPT高风险单胎孕妇的产前诊断染色体核型分析结果和Low-pass WGS检测结果进行了回顾性研究分析，并评估了Low-pass WGS对提高无创高风险孕妇的产前诊断异常检出率的作用。

1 材料与方法

1.1 病例资料

回顾性选择2018年1月—2019年8月间因无创产前检测提示高风险来中国科学技术大学附属第一医院(安徽省立医院)进行侵入性产前诊断、并且同时进行染色体核型分析和Low-pass WGS检测的165例单胎孕妇，年龄为20～35(31.3±5.5)岁，孕周为18～28周。该研究通过该院伦理委员会批准，并且纳入研究的所有孕妇均签署知情同意书。

1.2 研究方法

1.2.1

羊膜腔穿刺术 对孕妇的羊膜腔穿刺由具有产前诊断资质的医师在B超引导下进行，每个孕妇抽取3管羊水，每管10 ml，共30 ml，其中2管羊水进行细胞培养，供染色体核型分析，剩下1管羊水进行DNA提取，供Low-pass WGS检测。……