靖汝楠,冯静茹,王一孝,张颜颜,李真,李莉,刘昕,张伟东
(吉林大学药学院,吉林 长春 130000)
代谢组学(metabonomics/metabolomics)通过研究生物体系(细胞、组织或生物体)在受到外界刺激后其内部小分子代谢物的动态变化,进而揭示生物体整体功能状态。代谢组学主要对生物体内代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系,是系统生物学的组成部分。其研究对象大都是相对分子质量1 000 以内的小分子物质[1]。植物代谢组学是代谢组学的一个重要分支。到目前为止,已知植物大约有30 万种。植物独特的次生代谢可产生超过20 万种次生产物,所产生的代谢物的数量有20 万~100 万种[2]。同一植物在不同环境、不同部位、不同产地或者不同的炮制方法,所得到的代谢物均有差异。这些代谢物结构迥异,数量庞大,可以使植物很好地适应环境的变化,植物类中药的次生代谢物往往是与药效相关的活性成分,也通常作为研究中药材药效学的物质基础[3]。
代谢组学自从兴起之后,其代谢物代表的就是终端生物信息的含义,位于生命活动调控的末端,蕴含了丰富、全面的生物标志物的信息,在生命体研究中是重要的科研工具。植物代谢组学的一般研究流程,见图1,对于收集的样本进行前处理,通过气相色谱质谱联用(GC-MS)、液相色谱质谱联用(LC-MS)及核磁共振(NMR)等技术进行成分分析,用主成分分析(PCA)、聚类分析(HCA)、偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)及正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA)等方法对数据进行整合挖掘,得到生物标志物等有效信息。……