ox-LDL刺激的巨噬细胞中circRNAs差异表达及功能预测

2021-04-13 08:54:42叶浡之梁晓荷赵翊含薛淇泽黄周青蔡雪黎
温州医科大学学报 2021年3期
关键词:差异分析

叶浡之,梁晓荷,赵翊含,薛淇泽,黄周青,蔡雪黎

1.温州市心血管疾病研究重点实验室,温州医科大学附属第一医院 心血管内科,浙江 温州 325015;2.温州医科大学 第二临床医学院,浙江 温州 325035

冠状动脉粥样硬化性心脏病(冠心病)是心血管系统常见疾病,是人类致死的主要原因之一[1]。在冠心病的早期阶段即动脉粥样硬化起始阶段给予干预是预防冠心病的有效策略[2]。单核细胞在趋化因子的作用下迁入内皮膜下活化为巨噬细胞[3],吞噬同样在内膜下积聚的氧化型低密度脂蛋白(oxidized low density lipoprotein,ox-LDL),促进早期斑块脂质条纹的形成,同时巨噬细胞释放大量炎性因子,在动脉粥样硬化的进程中持续发挥作用[4]。探索ox-LDL刺激下巨噬细胞的生物学活动有助于更好地理解动脉粥样硬化的病理生理机制。

环状RNAs(circRNAs)是近年来非编码RNA研究中的明星分子,能够在转录后水平调控mRNA的表达,进而在心血管疾病如高血压[5]、心力衰竭[6]、心肌梗死[7]过程中发挥重要作用,但circRNAs是否可以通过调控ox-LDL刺激下的巨噬细胞生物学活动参与动脉粥样硬化的进展尚未见报道。因此,本研究利用ox-LDL构建巨噬细胞炎症模型,通过基因芯片结合生物信息学分析,预测circRNAs在ox-LDL刺激下的巨噬细胞炎症反应中的潜在作用机制。

1 材料和方法

1.1 细胞培养及巨噬细胞炎症模型制备 THP-1细胞购于美国模式培养物集存库(American type culture collection,ATCC)。在37 ℃,5% CO2的细胞培养箱中使用1640完全培养基(含10%胎牛血清和1%青链酶素混合液)培养THP-1细胞。实验细胞分为对照组和ox-LDL组。将THP-1细……

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