澳洲坚果MiSTPP6基因克隆及低温胁迫下表达分析

2021-04-15 18:53:05蔡元保杨祥燕李季东黄思婕李穆巫辅民
南方农业学报 2021年12期

蔡元保 杨祥燕 李季东 黄思婕 李穆 巫辅民

蔡元保(1981-),高級农艺师,主要从事果树分子生物学与遗传育种研究工作,主持国家自然科学基金项目、广西重点研发计划项目和广西自然科学基金等科研项目4项,并作为主要成员参与农业农村部行业科技专项、广西创新驱动发展专项等重大科研项目。以第一完成人或主要完成人获得省部级科技奖2项,地厅级科技奖4项;以第一发明人或第一完成人获得国家专利授权18项(其中发明专利6项)和计算机软件著作权登记6项。主持或主要参与广西地方标准2项,作物新品种登记5个;以第一作者或通讯作者在《南方农业学报》《植物学报》《植物生理学报》《植物遗传资源学报》等期刊上发表论文30多篇,并获得优秀论文13篇。

摘要:【目的】克隆澳洲坚果丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶(PP1)家族基因(MiSTPP6),并分析其不同组织及低温胁迫下的表达模式,为澳洲坚果PP1家族基因的抗寒分子机制提供理论依据。【方法】基于澳洲坚果转录组测序结果,利用RT-PCR技术克隆MiSTPP6基因,对其序列进行生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR检测其在不同组织及低温胁迫下的表达情况。【结果】从澳洲坚果中克隆获得MiSTPP6基因(GenBank登录号为MT374553),其cDNA全长2129 bp,最大的阅读框(ORF)长度为948 bp,编码315个氨基酸残基,含有PP1蛋白家族的典型结构域(MPP_PP1_PPKL)和特征性序列(LRGNHE)。MiSTPP6蛋白为稳定的亲水性蛋白,以丝氨酸磷酸化为主,可能定位于细胞质,属于非分泌型蛋白或膜蛋白,与已知植物PP1蛋白的氨基酸序列具有很高的相似性。……

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