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摘要:毛头鬼伞培养液具有较强的漆酶活性,漆酶在基质中木质素的降解和子实体的发育中发挥着重要作用。目前,人们已经完成毛头鬼伞基因组的测序,且数据已经释放至公共数据库中,但并未注释。为了掌握毛头鬼伞中漆酶的基因数量及其特征,基于已报道的毛头鬼伞漆酶蛋白的氨基酸序列,通过同源预测的方法从其基因组上预测获得21个漆酶基因,并采用ProtParam、SignalP 5.0、Sompa、TMHMM 2.0、SWISS-MODEL和WoLF PSORT等生物信息学工具对其中20个相应漆酶蛋白进行预测,分析其基本理化特性、信号肽、二级结构、跨膜结构、三级结构和亚细胞定位等。研究结果可为毛头鬼伞漆酶基因的克隆及分子作用机制等研究提供参考。
关键词:毛头鬼伞;基因预测;生物信息学;序列分析;三维结构
中图分类号: S188文献标志码: A
文章编号:1002-1302(2021)05-0067-08
漆酶(laccase,E.C.1.10.3.2)也称对苯二酚氧化还原酶,能对酚类物质进行单电子氧化,利用氧作为最终的电子受体,生成水作为唯一副产品。漆酶主要参与生物合成、木质素降解、形态发生及色素的生物合成等过程[1]。漆酶广泛存在于植物[2]、真菌[3]、细菌[4]和昆虫[5]中,真菌漆酶参与黑色素的产生、子实体的形成及植物发病机制[11]等生理过程。白腐真菌中的担子菌以其对木质素、纤维素和半纤维素的高效分解及转化为二氧化碳的能力而闻名[12],而且白腐真菌产生的漆酶具有较高的电势,比细菌或植物来源的漆酶有更高的氧化还原能力[13]。……