基于16S rDNA扩增子测序技术分析四川省奶牛乳房炎乳汁中微生物菌落多样性

肖璐，谢晶，于吉锋，廖党金，曹冶，林毅，李兴玉，潘梦，叶健强，叶勇刚，康润敏

(四川省畜牧科学研究院动物遗传育种四川省重点实验室，四川 成都 610066)

奶牛乳房炎是影响全球奶业发展的主要疾病之一，奶牛乳房炎是由微生物感染、物理或化学刺激等因素引起的奶牛乳房乳腺组织的炎症反应。据报道与统计，全世界约有1/3的奶牛患有各种类型的乳房炎，有30%的奶牛在泌乳期间至少患1次临床型乳房炎[1-2]。奶牛乳房炎可分为临床型乳房炎和亚临床型乳房炎(又称隐性乳房炎)，该病的致病因素复杂、发病率高、治愈反复发病率高，由于病原微生物的入侵，影响奶牛乳腺健康，导致产奶量下降、乳品质降低，困扰着奶牛业的经济效益与健康发展，给全球的奶牛产业带来了巨大的经济损失[3]。引发奶牛乳房炎的病原微生物包括：球菌、杆菌、支原体、真菌、酵母和病毒等，根据来源和传播途径可以分为：传染型致病原和环境致病原，传染型致病原主要包括无乳链球菌、停乳链球菌、金黄色葡萄球菌和支原体等，环境型致病原主要包括大肠杆菌、乳房链球菌、克雷伯氏菌、绿脓杆菌、产气肠杆菌、变形杆菌、凝固酶阴性葡萄球菌、牛棒状杆菌、真菌及酵母菌等[4]。研究表明导致临床中奶牛乳房炎发生的致病菌以金黄色葡萄球菌、无乳链球菌、停乳链球菌和大肠杆菌为主，占到引起奶牛乳房炎发病率的80%～90%[5]，但不同地方导致奶牛乳房炎主要致病菌流行的趋势也存在显著性差异，且耐药性也不尽相同[6-7]。……