胃癌组织环状RNA表达谱分析

杨青茹，王华，周松峰，申红星

(1. 江苏大学医学院， 江苏 镇江 212013； 2. 南通大学医学院， 江苏 南通 226019)

胃癌是全球常见的恶性肿瘤，也是导致死亡的第二大主要原因[1]。胃癌的致病因素很多，如EB病毒感染、幽门螺杆菌感染等[2]。胃癌的发生不仅影响蛋白代谢异常[3]，也涉及微小RNA(microRNA，miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circluar RNA， circRNA)等非编码RNA的异常表达。CircRNAs自2013年发现其生物学功能以来，逐渐成为研究的热点，研究显示circRNAs参与癌症等多种疾病的发生发展过程[4]。CircRNAs分子是一类不具有5′末端帽子和3′末端poly(A)尾巴，并通过共价键形成环形的非编码RNA分子，具有一定的组织、时序和疾病特异性，并发挥调节转录、翻译和表达水平等方面的生物学功能[5-6]。已有研究表明，circ-HuR异位表达在体内外均能抑制胃癌细胞的生长、侵袭和转移[7]。部分circRNAs分子含miRNAs应答元件(miRNA response element，MRE)，可充当竞争性内源RNA(competing endogenous RNA，ceRNA)，与miRNAs结合，发挥miRNAs海绵的作用，上调靶基因表达水平；也可以翻译成蛋白质来发挥作用[8]。CeRNA调控在癌症进展中发挥关键作用，如circRNA_LARP4通过抑制miR-424-5p和调控LATS1的表达，抑制胃癌细胞的增殖和侵袭[9]；circPDSS1通过海绵miR-186-5p和调节NEK2促进胃癌进展[10]；circRNA_100782通过海绵吸附miR-574-3p，抑制Rb表达，促进胃癌的增殖和转移[11]。

虽然多个报道显示circRNAs参与调节胃癌的发生发展，但是非编码RNA尤其是circRNAs和miRNAs在胃癌中的详细作用机制依然不清楚。本研究通过分析胃癌相关的多个circRNAs的测序数据，旨在揭示circRNAs-miRNAs-mRNAs网络通过生物进程、细胞组分和分子功能3个方面参与胃癌发生发展的机制。

1 材料与方法

1.1 差异表达circRNAs的获得

使用美国国家生物技术……