水稻苗期抗稻瘟病基因全基因组关联分析

陈汝斌，彭沙莎，王 丹*，康厚祥

（1. 湖南农业大学农学院，长沙 410128；2. 中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室，北京 100193）

水稻（Oryzae sativaL.）是世界上最重要的粮食作物之一，养育了世界近一半以上的人口［1］。据研究，到2050 年，平均每年需要增加44 万t 以上的粮食产量以满足全球的粮食需求［2］。由稻瘟菌（Magnaporthe oryzae）引起的稻瘟病是一种长期侵害水稻的真菌病害，几乎发生在水稻生长发育的整个时期［3］。根据侵染部位可将其分为苗瘟、叶瘟、穗颈瘟、节瘟以及谷粒瘟等类型［4］。每年因稻瘟病造成的水稻收成损失可达到10%～30%，严重时达50%以上，甚至颗粒无收，给我国的粮食生产及稻米品质造成了严重的损失。目前针对稻瘟病发生的防止措施是化学药剂防治以及培育优良广谱抗性品种。相比于前者，后者具有经济、环保、高效等特点［5］。然而，由于田间稻瘟菌生理小种基数大、传播和变异速度快等原因，已有抗病基因的水稻其抗性在推广3～5 年后容易丧失，因此快速挖掘新的稻瘟病抗性基因对培育抗稻瘟病品种具有重大的意义［6］。

目前，定位复杂性状主要有两种方式，一是经典的连锁分析，二是关联分析。连锁分析基于双亲杂交构建遗传作图群体，通过遗传标记对个体进行基因分型，并对结果进行分析。但该方法存在构建群体耗费时间长且每个位点只能鉴定2 个等位基因等缺点，因此所鉴定数量性状位点（quantitative trait locus，QTL）的数量受到限制［7］。而关联分析相较于连锁分析有以下几个优点：1）目标群体为自然群体，不需要耗费大量时间构建双亲作图群体，极大地节约了时间和降低了工作强度；……