PDIA4基因沉默对胶质瘤细胞凋亡的影响

2021-06-23 11:45:20朱传华谢琳刘安民
岭南现代临床外科 2021年2期
关键词:差异实验检测

朱传华,谢琳,刘安民

胶质瘤是神经中枢系统最常见的原发恶性肿瘤,且传统手术、化疗、放疗及目前已有的靶向治疗对胶质瘤的治疗效果不佳。目前对于胶质瘤的病因仍不清楚,因此探讨其发病机制对于胶质瘤的诊疗具有重要意义[1]。蛋白二硫键异构酶家族成员4(protein disulfide isomerase family a member 4,PDIA4)定位于细胞内质网发挥功能,参与蛋白质折叠、硫醇-二硫键交换反应和内质网应激反应。近些年来越来越多研究表明,PDIA4基因是肿瘤诊断和治疗的潜在靶标[2],但其在胶质瘤发生发展中的作用机制不明。本研究利用RNAi技术沉默PDIA4表达,探索其对胶质瘤增殖和凋亡的影响。

1 材料和方法

1.1 研究对象

人胶质瘤细胞系U251、U87、HA1800由中山大学孙逸仙纪念医院医学研究中心提供。DMEM高糖培养基、胎牛血清、细胞用青霉素/链霉素和EDTA胰酶购自美国Gibco公司;星形胶质细胞培养基购自ScienCell公司;alarma blue试剂购于Sigma公司;LipofectamineTM3000、BCA蛋白定量试剂盒、ECL化学发光试剂盒购自美国Invitrogen公司;RNA-Quick Purification Kit购自上海奕杉生物;cDNA Synthesis SuperMix和SYBR Green Master Mix购自上海翊圣生物;4%多聚甲醛、结晶紫染液购自上海碧云天生物技术有限公司;蛋白提取RIPA裂解液购自康为世纪公司;cleaved-caspase-3、cleavedcaspase-7单克隆抗体、羊抗兔二抗购自CST公司。引物由苏州泓迅生物科技公司合成,靶向PDIA4的小干扰RNA及阴性对照购自上海吉玛制药技术有限公司,siRNA序列:si-PDIA4#768 5′-GCAAGCGUUCUCCUCCAAUTT-3′,si-PDIA4#1829 5′-GCCUGGUCAUCGCCAAGAUTT-3′,siNC 5′-UUCUCCGAACGUGUCACGUTT-3′。

1.2 CGGA数据库分析

从CGGA(中国脑胶质瘤基因组图谱计划)网 站(http://cgga.org.cn/)下 载mRNAseq_693[3]和mRNAseq_325[4]的RNAseq数据及相应临床数据,使用R语言的“sva”和“limma”包进行批次校正,应用kruskal检验分析基因表达量和肿瘤级别的相关性,利用“survival”和“survminer”u语言包进行生存分析并作图,基因高表达组和低表达组通过中位值划分。……

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