LysM结构域1基因甲基化在胶质母细胞瘤中的临床意义

2021-06-27 02:57:46吕洪涛李俊孙锡同
中国医科大学学报 2021年6期
关键词:差异分析

吕洪涛,李俊,孙锡同

(大连医科大学附属第一医院 1.神经外科;2.急诊科,辽宁 大连 116011)

胶质瘤是中枢神经系统中最具侵袭性和致死性的肿瘤,以高复发率和高死亡率为显著特征[1]。尽管许多学者付出了巨大努力,但在胶质瘤治疗方面几乎没有取得进展[2]。胶质母细胞瘤是恶性程度最高的颅内恶性肿瘤,属于Ⅳ级恶性胶质瘤,是仅次于脑膜瘤的第二常见中枢神经系统肿瘤,同时也是侵袭性最高的颅内恶性肿瘤[3]。在无任何治疗情况下,胶质母细胞瘤患者中位生存时间仅为3个月[4]。因此,研究胶质母细胞瘤的潜在生物标志物并为疾病的诊断和治疗提供新的见解至关重要。过去的十年中,表观遗传修饰尤其是DNA甲基化,已成为癌症研究的重点。DNA甲基化的变化可能会影响基因表达和反馈机制,并产生各种促进或抑制肿瘤的作用[5]。目前,研究已经报道多种甲基化基因生物标志物,如MGMT启动子甲基化是胶质瘤预后的主要生物标志物[6],并可预测胶质母细胞瘤患者对替莫唑胺治疗的反应性[7]。本研究利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和UCSC Xena数据库中胶质母细胞瘤患者的相关数据,对复发与无复发胶质母细胞瘤组织的基因甲基化差异程度进行分析,筛选出具有差异甲基化的基因,并进一步探讨该基因能否成为新的胶质母细胞瘤预后标志物,为胶质母细胞瘤的治疗提供新的策略。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 细胞系:人胶质瘤细胞系U373,购自中国科学院上海细胞所。

1.1.2 主要试剂:高糖DMEM 培养基(美国Gibco公司);……

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