基于综合数据库分析ASXL1基因突变对子宫内膜癌预后的影响及作用机制

2021-07-05 05:49:56范玥韩馨乐杜俊
中国现代医药杂志 2021年5期
关键词:基因突变数据库信号

范玥 韩馨乐 杜俊

子宫内膜癌(Endometrial carcinoma,EC)是女性第六大常见的恶性肿瘤。近年来,发病率持续上升并呈现年轻化趋势,严重威胁女性健康[1]。根据2015年中国癌症数据分析显示子宫内膜癌预计年发病率为60/10万,死亡率约为20/10万,发病率也呈逐年上升趋势[2]。2013年,人类癌症基因组图谱(The cancer genome atlas,TCGA)根据不同突变方式和拷贝数将EC划分为4种分子分型,即POLE(DNA聚合酶ε)突变型、微卫星不稳定高突变型、低拷贝数型和高拷贝数型。该分子分型对预后判断及精准治疗有重要意义,但也存在局限性[3,4]。在肿瘤精准治疗的背景下,探讨基因突变的预后意义及作用机制,对靶向治疗的靶点选择具有重要参考意义。ASXL1(Additional sex combs like 1)基因首次于2009年在骨髓增生异常综合征(MDS)中报道[5],其位于染色体20q11,靠近DNMT3B基因[6],由12个外显子组成。根据既往研究,ASXL1基因突变在血液系统髓系肿瘤中是预后不良的生物学标志物[7],包括骨髓增殖性肿瘤(MPN)、骨髓增生异常综合征(MDS)、慢性粒单核细胞白血病(CMML)和急性髓系白血病(AML)等。然而,ASXL1在EC中的预后意义鲜有报道,其相关机制仍有待研究。本研究旨在通过多种肿瘤综合数据库,分析ASXL1基因突变在EC患者中的预后意义及可能的作用机制,为EC的精准治疗提供参考依据。

1 材料与方法

1.1 数据来源与方法基于GEPIA数据库(http://gepia.cancerpku.cn/)分析ASXL1基因突变在EC患者中的预后意义及其与临床分期的关系。同时,通过获取在EC中与ASXL1有相似表达特征的前200个基因,对其信号通路相关性及蛋白质互作网络做了进一步分析。

基于Kaplan-Meier plotter数据库(https://kmplot.com/analysis/),汇总ASXL1基因突变在EC患者中的预后意义,包括总生存期(Overall survival,OS)与无复发生存期(Relapse-free survival,RFS)。……

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