AaMcm1基因调控链格孢菌丝生长的转录组初步分析

2021-07-16 12:08:20李珊珊毛胜洁刘琛徐后娟张丽
山东农业科学 2021年6期
关键词:生长差异分析

李珊珊,毛胜洁,刘琛,徐后娟,张丽

(山东农业大学植物保护学院,山东 泰安 271018)

链格孢菌(Alternaria alternata)属链格孢属,为一种重要的致病真菌,其侵染烟草导致的赤星病是一种发生在烟叶成熟后期的真菌性病害,发病快、易于流行,给烟叶生产带来巨大的经济损失[1]。链格孢菌还可侵染多种作物如梨、枣、柑橘、番茄等[2]。MADS box蛋白是高度保守的结合型转录因子家族,在真核生物中广泛存在并参与多种生物学过程[3-5]。在动物和真菌中存在两种类型的MADS box基因,分别为SRF-like(类型Ⅰ)和MEF2-like(类型Ⅱ)[6]。Smp1和Rlm1属于MEF2型,Arg80和Mcm1属于SRF型[7,8]。Mcm1基因目前已在多种真菌中得到研究。在酿酒酵母中,Mcm1在细胞周期转录、微小染色体的维持、一般代谢等方面发挥重要作用[9-11];在白色念珠菌(Candida albicans)中,CaMcm1对菌落的形态建成起着重要作用[12];在稻瘟菌(Magnaporthe oryzae)中,MoMcm1参与雄性不育、小分生孢子的产生及致病等过程[13];在核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum(Lib.)de Bary)中,SsMcm1被证明能够调控菌丝生长和毒力[14];在禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum)中,FgMcm1基因调控细胞确认、有性和无性生殖、次级代谢和致病力等[15]。本课题组前期将链格孢中的AaMcm1基因进行敲除并得到了突变体△AaMcm1,突变体生长速度严重变缓,与野生菌相比7天的生长降低率达到74.54%,分生孢子产量减少,黑色素和几丁质含量降低,致病力减弱(未发表),构建回补体发现回补体性状基本恢复至野生菌水平。本研究对突变体△AaMcm1及其野生菌进行转录组测序研究,分析差异表达基因和信号通路,以期从转录组层面分析突变体生长变化的原因。

1 材料与方法

1.1 供试菌株

链格孢野生型菌株YS-16(Alternaria alternata YS-16)和突变体△AaMcm1(AaMcm1基因敲除)为课题组前期获得。……

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