对Deinococcus actinosclerus RM菌株分泌蛋白的预测

柯 野，彭阳选，李昊然，刘曜荣，梅颖诗，郭 阳

（韶关学院 英东生物与农业学院，广东 韶关 512005）

随着国家政策对畜牧养殖业扶持与推广，使得我国畜牧养殖业飞速发展，我国家禽生产量已跃居全球第2位，据估算，此行业每年产生的干羽毛量约130万t［1］.羽毛中的粗蛋白含量高达80%，氨基酸含量则达到70%，由此可见，羽毛具有十分可观的开发利用价值［2］.羽毛的主要成分是角蛋白，角蛋白亦被称为硬性角蛋白，不容易被一般的蛋白酶所降解.然而，废弃的羽毛不仅对环境有极大的危害作用，而且羽毛中的蛋白质资源也不能得到充分有效的利用［3］.因此，越来越多的研究者关注于对羽毛的有效降解.一方面，以期实现羽毛中蛋白质的高值化利用.另一方面，则希望通过经济环保的方式，解决废弃羽毛对生态环境带来的危害.据报道，在自然界中已离获得具有降解废弃羽毛的微生物30多种，并且在细菌、放线菌和真菌［4-6］中均有分布，如细菌中的枯草芽孢杆菌属和放线菌中链霉菌属，它们主要产生碱性蛋白酶，可应用于高蛋白动物饲料、原料皮的脱毛和植物含氮肥料添加剂等领域的开发［7］.

本文前期研究中已分离筛选获得一株Dactinosclerus actinosclerusRM（下文简称RM菌株）野生型菌株，它是一株具有高效降解羽毛的细菌菌株（初测对4.0%的羽毛粉有高达64.0%的降解率）.目前未见对该菌株所属的属和种的分泌蛋白系统研究.因此，本文采用生物信息学知识和在线网站对RM菌株全基因组序列编码……