尤斯涵 郭春燕
河北北方学院药学系,张家口,075000,中国
乳腺癌(breast cancer,BC)是指发生在乳腺上皮组织的恶性肿瘤,其病因复杂,易受环境和遗传因素的影响[1]。尽管目前有了很多治疗BC 的方法,比如放射治疗和手术、激素阻断剂的给药、化学疗法和单克隆抗体,但是仍有许多患者在治疗后出现乳腺癌复发等不良结果[2]。脐带间充质干细胞(umbilical cord mesenchymal stem cells,UC-MSCs)是一种存在于新生儿脐带组织中的多功能干细胞[3]。UC-MSCs 具有易于获得、扩增等多个优点[4];由于UC-MSCs 的表面抗原不突出,对移植细胞的免疫排斥反应不明显,配型要求不严格,便于移植[5-6]。至今,已有多项试验评估了UC-MSCs 治疗恶性肿瘤(malignant tumor)的疗效,如乳腺癌、前列腺癌、肺癌等[7-8]。
网络药理学旨在研究靶点、药物、疾病和通路之间复杂多变的关系,为药物发现提供了一种新方法[9]。目前,生物信息学已成为通过处理大量原始数据来研究系统特性的新工具。因此,网络药理学和生物信息学的方法不仅帮助我们获取治疗疾病的差异基因,还能给出与疾病相关的生物学通路等信息。基于此种背景,本研究将通过采用GEO 数据库利用网络药理学和生物信息学的方法对所选临床实验数据进行分析,研究UC-MSCs 治疗BC 的核心靶点及差异基因,初步探索它们的作用与功能,希望能为治疗BC 提供新的方向。
进入NCBI(www.ncbi.com.cn)选择GEO 数据库以“Human umbilical cord”、“Homo sapiens”为关键词进行检索,得到了Naomi Ohta 等[10]提供的芯片数据GSE64827,下载UC-MSCs 细胞治疗的原始数据。
1.2.1 差异基因的获取
通过检索Pubmed、Embase、Cochrane Library 和Web of Science 数据库,搜索UC-MSCs 抑制和促进肿瘤的文献。……