猪IGFBP3基因生物信息学分析

许金根, 胡 洪, 王重龙, 李庆岗*

(1.安徽科技学院 动物科学学院，动物营养调控与健康安徽省重点实验室，安徽 凤阳 233100；2.安徽省农业科学院 畜牧兽医研究所，安徽 合肥 230031)

胰岛素样生长因子结合蛋白(Insulin-like growth factor binding proteins,IGFBPs)的生物学作用主要是与胰岛素样生长因子(insulin-like growth factor,IGF)结合,通过延长IGF的半衰期而调节IGF的功能,以及独立于IGF的内在活性。作为

IGFBP3

家族的一个重要成员,

IGFBP3

是血清中与IGF结合的主要蛋白,通过调控IGF的生物活性而对机体生长发育起作用。因此,

IGFBP3

是影响猪生长发育的功能候选基因。研究发现,大白猪

IGFBP3

基因G3695A位点不同基因型个体的生长速度和背膘厚存在显著差异。在长白猪×蓝塘猪F资源群中,

IGFBP3

基因A2670G位点与体长、眼肌面积、皮与脂肪率、胴体瘦肉量、瘦肉率存在显著或极显著相关。在蓝塘猪×长白猪杂交 群体中,

IGFBP3

不同合并基因型TAT/TAT与GGC/GGC个体的背膘厚、肉色存在显著差异。猪

IGFBP3

基因序列已被克隆出来,包括5个外显子和4个内含子。但目前关于猪

IGFBP3

基因序列及其编码蛋白质结构和特征的研究比较少。因此,本试验综合利用生物信息学分析猪

IGFBP3

基因序列及其编码蛋白质的结构和特征,为研究该基因在猪生长发育中的调控作用提供参考。

1 材料与方法

1.1 供试材料

从美国国立生物技术信息中心(NCBI)数据库中(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/),下载猪

IGFBP3

基因mRNA序列(登录号:NM001005156)及其编码的蛋白质序列(登录号:NP001005156)。

同时，下载其它种属黄牛(登录号:NP_776981)、水牛(登录号:XP_006051369)、绵羊(登录号:NP_001152748)、山羊(登录号:NP_001301148)、猫(登录号:XP_023105911)、狗(登录号:XP_003639605)、小鼠(登录号:NP_032369)、大鼠(登录号:NP_036720)、鸡(登录号:NP_001094504)和鸭(登录号:XP_027307091)的IGFBP3蛋白序列。……