谢强 谢瑞玉 徐添天
随着抗菌药物的大量及不合理使用,多重耐药和泛耐药菌在临床上不断出现,严重威胁人类健康。耐碳青霉烯酶类抗菌药物的肠杆菌目细菌,特别是耐碳青霉烯类抗菌药物的肺炎克雷伯菌(CRKP)危害尤为严重[1],全国细菌耐药监测网的数据显示,亚胺培南耐药率从2014年的4.8%升至2019年的10.5%[2]。由于CRKP的高传播力和高耐药率以及CRKP感染者的高死亡率,CRKP引起临床广泛关注[3,4]。近年来,我院肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类抗菌药物的耐药率呈上升趋势[5]。因此,研究我院CRKP的耐药机制,对遏制我院CRKP的流行和传播有重要意义。本研究以全基因组测序技术全面研究本院分离的CRKP的耐药基因分布,探讨其与耐药表型的相关性,现报道如下:
1 菌株来源 收集我院2020年1月~2020年11月分离的临床非重复CRKP 28株。其中26株来自呼吸道标本,2株来自血液标本。
2 主要仪器与试剂 全自动微生物鉴定仪VITEK-2 Compact及AST-N334药敏卡购自法国梅里埃公司;Heal Force A2型生物安全柜购自力康国际贸易(上海)有限公司;SHP-400E型智能生化培养箱购自上海三发科学仪器有限公司;台式高速离心机、微量移液器购自德国Eppendorf公司;细菌基因组DNA提取试剂盒购于天根生华科技(北京)有限公司;血平板、麦康凯平板和MH平板均购自郑州安图有限公司;药敏纸片购自英国Oxoid公司。
3 细菌鉴定和药敏试验 采用VITEK-2 Compact全自动微生物分析系统,部分药物补充试验采用纸片扩散法(K-B法),具体标准参照CLIS 2019[6]推荐的方法。
4 全基因序列测定 用天根生华科技(北京)有限公司的细菌基因组DNA提取试剂盒提取待测细菌基因组。……