福建省猪圆环病毒4型PCR检测及全基因组序列分析

刘建奎，李 娜，吴熠丹，邓小莺，毛 婉，黄晓紫，张焦杰，黄夏玲，魏春华

(龙岩学院生命科学学院/福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室/福建省生猪疫病防控工程技术研究中心，福建龙岩 364000)

猪圆环病毒(Porcine circovirus，PCV)根据其抗原性和基因组特性分为猪圆环病毒1型(Porcine circovirus type 1，PCV1)、猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2，PCV2)和2016年新发的猪圆环病毒3型(Porcine circovirus type 3，PCV3)3个型[1-4]。PCV1对猪无致病性，而PCV2是猪圆环病毒相关疾病(PCVAD)的主要病原，是当今危害世界养猪业最严重的病毒之一，给世界养猪业带来了严重的经济损失[5-8]。研究表明，PCV3在猪场普遍存在，可能与呼吸系统疾病和母猪繁殖障碍有关[3-4]。2019年，我国学者从临床表现呼吸道疾病、肠道疾病和猪皮炎肾病综合征(PDNS)的猪中发现了一种新型的圆环病毒，命名为猪圆环病毒4型(PCV4)，引起了国内学者的高度重视[9]。

PCV4基因组全长为1 770 bp，包含2个主要开放阅读框(ORF)，即ORF1和ORF2，分别编码Rep蛋白和Cap蛋白。序列分析表明，PCV4与PCV1、PCV2及PCV3代表性毒株的核苷酸同源性仅为50%左右，而与水貂圆环病毒同源性较高，约为67%[9]。研究人员推测，PCV4可能与呼吸道症状、肠道症状及PDNS存在一定关联[9-10]。福建省是我国养猪大省，为了解福建省规模化猪场PCV4的感染和流行情况，本研究收集具有PMWS症状的发病猪组织病料或血清200份，进行流行病学调查及PCV4全基因组克隆，探求其分子流行特征，为该病毒的后续研究提供基础资料。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 样品来源 2018年10月至2019年12月采集福建省龙岩市、漳州市、莆田市、泉州市等多个规模化猪场200份表现为进行性消瘦、皮肤苍白或黄疸、呼吸急促等疑似PMWS发病猪的临床样品，包括脾脏和肾脏等病料和血清等，置-80℃冰箱保存备用。……