MADLI-TOF MS自建库在马尔尼菲篮状菌快速鉴定中的应用

2021-09-01 00:56:18郭鹏豪伍众文邱丹萍谢梅英刘敏廖康
中国真菌学杂志 2021年4期
关键词:数据库

郭鹏豪 伍众文 邱丹萍 谢梅英 刘敏 廖康

(1.中山大学附属第一医院检验科,广州 520080; 2.广西玉林市人民医院检验科,玉林 537000;3.广西防城港市人民医院检验科,防城港 538000)

马尔尼菲篮状菌(Talaromycesmarneffei)既往称为马尔尼菲青霉[1-2],1956年由Capponi等从中华竹鼠中分离出来[3]。该菌是一种双相真菌,在不同温度下具有不同的菌落形态[4]。在HIV/AIDS患者中,马尔尼菲篮状菌是仅次于结核分枝杆菌和隐球菌的第三大病原体[5]。在香港约有10%的HIV/AIDS患者感染马尔尼菲篮状菌[6]。作为临床侵袭性真菌感染的重要病原体之一,目前马尔尼菲篮状菌鉴定主要依赖于传统的形态学鉴定和基因测序。然而形态学鉴定耗时、准确率低;基因测序目前难以在临床实验室中常规进行。因此,如何准确、快速地鉴定马尔尼菲篮状菌仍然是一个难题。

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)是一种革命性的病原体鉴定技术,其鉴定速度快、准确性高[7]。Vitek MS是法国生物梅里埃公司生产的一种商业化用于病原体鉴定的质谱仪。目前Vitek MS的IVD数据库(版本3.0)和RUO SARAMIS数据库(版本4.14)均无法对马尔尼菲篮状菌进行鉴定。本研究通过在Vitek MS的RUO模式建立包含马尔尼菲篮状菌超级图谱的自建库,实现Vitek MS对马尔尼菲篮状菌进行快速、准确的鉴定。

1 材料与方法

1.1 菌株

共收集马尔尼菲篮状菌41株,包括40株临床菌株(剔除同一患者的重复菌株)和标准菌株ATCC18224。临床菌株来自广东省广州市(6株),广西壮族自治区玉林市(20株)和广西壮族自治区防城港市(14株)。标准菌株ATCC18224和15株临床菌株(每个城市随机选取5株菌)用于建立马尔尼菲篮状菌自建库(见表1);……

登录APP查看全文

猜你喜欢
数据库
数据库
财经(2017年15期)2017-07-03 22:40:49
数据库
财经(2017年2期)2017-03-10 14:35:35
数据库
财经(2016年15期)2016-06-03 07:38:02
数据库
财经(2016年3期)2016-03-07 07:44:46
数据库
财经(2016年6期)2016-02-24 07:41:51
数据库
财经(2015年3期)2015-06-09 17:41:31
数据库
财经(2014年21期)2014-08-18 01:50:18
数据库
财经(2014年6期)2014-03-12 08:28:19
数据库
财经(2013年6期)2013-04-29 17:59:30
数据库
财经(2010年20期)2010-10-19 01:48:32