卵巢子宫内膜样癌免疫相关基因的生物信息学分析

陈聪 倪乐宜 陈育梅

卵巢子宫内膜样癌是来源于子宫内膜和卵巢表面上皮的卵巢上皮性恶性肿瘤，占卵巢上皮性肿瘤的10%[1]。子宫内膜异位症和上皮性卵巢癌之间的相关性一直有所报道，有学者认为子宫内膜异位症可能是上皮性卵巢癌的癌前病变[2]；子宫内膜异位症患者的卵巢癌风险增加[3]。子宫内膜异位症是一种与免疫及炎症反应相关的慢性疾病，发生机制与多因素相关，其中涉及到癌基因的激活和抑癌基因的失活等[4]。近年来生物信息学分析方法为肿瘤发生机制、早期诊断、预后生物标志物和治疗靶标等研究提供了思路[5]。本研究通过高通量基因表达（gene expression databases，GEO）数据库识别由正常子宫内膜向卵巢子宫内膜样癌发展潜在的免疫相关生物标志物，进行生物学功能和信号通路分析，探讨其相互作用网络，以期为卵巢子宫内膜样癌的发病机制、早期诊断和预后提供理论依据。

1 材料和方法

1.1 芯片数据 从GEO数据库（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo）搜索关键词“卵巢子宫内膜样癌”，样本满足以下条件：（1）使用从人体组织获得的样本；（2）芯片同时包含健康样本和卵巢子宫内膜样癌肿瘤组织；（3）样本总数≥10，且数据处理合格。获得满足条件的GSE57545芯片数据微阵列数据集，GSE57545数据集中包含29份正常子宫内膜样本和18份卵巢子宫内膜样癌样本。

1.3 差异表达基因生物信息学分析 本研究使用DAVID6.8在线数据分析平台（https://david.ncifcrf.gov/summary.jsp）[6]对差异表达基因进行基因本体（gene ontology，GO）和京都基因与基因组百科全书（kyoto encyclopedia of genes and genomes，KEGG）富集分析提高结果……