芽孢杆菌LM基于全基因组的分类鉴定及抑菌原理的 研究

蔡国磊 陆小凯 娄水珠 杨海英 杜刚

（1. 云南民族大学民族医药学院，昆明 650500；2. 云南民族大学化学与环境学院，昆明 650500）

泡菜中常见的乳酸细菌有植物乳杆菌、短乳杆菌和肠膜明串珠菌等菌类比较丰富。在本研究从泡菜中分离得到了一株具有抗黑曲霉活性的解淀粉芽孢杆菌。芽孢杆菌为一种极具生防价值的菌种，有的研究有利用菌株 FZB24 和 B9601-Y2 开发的生物制剂对镰刀菌和丝核菌引起的根腐病和枯萎病［1-2］。芽孢杆菌合成的抗菌物质主要分为两类，一类是分子量300-3 000 kD的非核糖体合成的抗生素，多数为 iturin、surfactin、fengycin 等环形脂肽，少数是氨基糖苷；另一类是核糖体合成的细菌素、几丁质酶等蛋白类抗生素［3-4］。解淀粉芽孢杆菌（Bacillus amyloliquefaciens）最早由 Priest等［5］发现并鉴定，解淀粉芽孢杆菌（B.amyloliquefaciens）是有典型特征的芽孢杆菌，它的细胞呈直杆状，为革兰氏阳性菌株能合成脂肽类、肽类、磷脂类等物质［6］。解淀粉芽孢杆菌（B. amyloliquefaciens）以及枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）产生的脂肽类抗生素有表面活性素（surfactin）、伊枯草菌素（iturins）和芬荠素（fengycin）三大类［7］。表面活性素最初鉴定和命名由Arima等完成［8］，其化学结构由Kakinuma等确定［4］，iturins 和fengycins 类抗生素对多种植物病原真菌具有较强的拮抗活性surfactin 虽然自身对真菌没有明显的抑菌活性，但surfactin 可增强 iturins 或fengycins 的抑菌活性［9］。解淀粉芽孢杆菌的具有抗菌及植物互作等方面的作用［2，10］，在生物防治和医学中具有潜在应用价值。

在菌株的分类鉴定中，有些微生物亲缘关系较近，16S rRNA 序列相似度太高无法进行有效的区分［11］。随着二代测序（next generation sequencing，NGS）技术的出现以及测序成本的降低，通过对全基因组序列信息的分析使微生物进行分类鉴定和抗性潜力变得更加方便快捷。……