枯草芽孢杆菌蛋白酶结构与表达载体分析

2021-09-25 08:45:26张荣宗江丁文陈锦香
农业技术与装备 2021年7期
关键词:结构

张荣宗,江丁文,陈锦香

(1.惠安县乡镇畜牧兽医站,福建 泉州 362100;2.惠安县螺城镇经济发展服务中心,福建 泉州 362100)

枯草芽孢杆菌能分泌多种酶,具有多种功能,能够促进肠道消化、体表消毒、消灭蚊虫蜱蚤和寄生物、降解养殖水体有机质、适应高温密闭环境、有较强的免疫原性、抑制有毒有害物质生成和减少面源污染等;大肠杆菌、芽孢杆菌、酵母、昆虫、哺乳动物、线虫动物等生物细胞可以作为克隆、重组杂交、突变基因、转基因的表达载体,它们的基因密码子表达上存在偏好性,一般蛋白酶基因密码子表达也存在偏好性[1-13]。本文拟分析枯草芽孢杆菌蛋白酶结构,并比较其基因密码子和生物细胞载体基因密码子偏好性,以便选择合适的宿主表达系统;所引用的序列数据为公开数据,用以了解与动物生产科学、种质资源和产品质量、病虫鼠害预测预报、蚕丝和毛皮净化、化学消毒和菌虫残留、良种基因细胞和胚胎保护、小微动物药用和疗养、动植物细胞培养肉、动物饮水饲料饲草和食果食蔬、动物屠宰加工、畜牧养殖设施保养、抗菌喷淋安全防护、生理生长发育、色素发酵、营养代谢、生态平衡、无害化处理和污染控制等有关的生物细胞表达,不负责侵权责任,其中选取的编码基因为成熟肽的枯草芽孢杆菌蛋白酶基因。

1 枯草芽孢杆菌蛋白酶结构预测

根据SWISS-MODEL的同源建模(homology modeling),对成熟肽的枯草芽孢杆菌蛋白酶氨基酸序列进行三维空间结构预测,结果如图1所示。……

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