二、三倍体牙鲆肌肉和脑组织实时定量PCR内参基因的筛选及鉴定

2021-10-19 09:05:30吴志昊谭训刚
海洋科学 2021年9期
关键词:差异分析

杜 娜 , 张 敏, 吴志昊 焦 爽 尤 锋 谭训刚

(1. 中国科学院 海洋研究所 中国科学院海洋大科学研究中心, 中国科学院 实验海洋生物学重点实验室 山东省实验海洋生物学重点实验室, 山东 青岛 266071; 2. 青岛海洋科学与技术试点国家实验室 海洋生物与生物技术实验室, 山东 青岛 266237; 3. 中国科学院大学, 北京 100049; 4. 青岛科技大学, 山东 青岛266061)

细胞决定、生长发育、分化、繁殖、细胞癌变及凋亡等生化途径都与基因的表达模式息息相关。具有灵敏度高、动态变化范围大、高通量且精确定量的实时定量聚合酶链式反应(qPCR)被应用于检测基因表达水平变化的研究中[1], 包括相对定量和绝对定量两种方法, 其中应用最为广泛的是相对定量方法。但是该方法受到多种因素的影响[2-3], 其中一个重要的因素就是相对实时荧光定量方法中的内源参考基因或管家基因的选择。由于相对定量是将目的基因表达水平与标准化内参基因相比较, 这就要求所选取内源参比基因在生物的不同生长过程及不同组织间具有尽可能小的变化。

多倍体诱导是一种产生新基因型的育种方法。当生物被诱导成多倍体时, 其基因组的数量和结构会发生变化, 并导致某些基因的表达水平发生改变[4]、转录水平的调控和翻译后修饰的改变, 这些都可能引起基因过表达或基因沉默, 结果导致生物表型改变[5]。一些研究表明, 在某些三倍体鱼类中, 其基因表达水平降低到二倍体的状态, 这种现象称为剂量补偿效应[6]。……

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